More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0708 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  100 
 
 		 424 aa  832    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  45.45 
 
 		 409 aa  289  6e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  45.59 
 
 		 372 aa  256  8e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  44.38 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  43.49 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  43.18 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  38.58 
 
 		 436 aa  232  8.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  40.15 
 
 		 413 aa  232  9e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  40.43 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  38.69 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  38.05 
 
 		 439 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  36.49 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  39.56 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  40.98 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  37.9 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  40.11 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  39.2 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.69 
 
 		 436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  37.85 
 
 		 444 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  35.03 
 
 		 553 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  38.8 
 
 		 440 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  39.53 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  37.79 
 
 		 549 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  33 
 
 		 437 aa  176  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  37.1 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  36.64 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  36.47 
 
 		 441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  36.95 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  36.99 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  36.44 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  36.57 
 
 		 564 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  36.57 
 
 		 564 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  34.21 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  36.39 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  40.98 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  34.89 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  34.89 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  34.89 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  35.43 
 
 		 574 aa  170  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  34.89 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  35.38 
 
 		 420 aa  170  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  35.07 
 
 		 429 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  35.67 
 
 		 421 aa  169  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  34.45 
 
 		 461 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  36.84 
 
 		 582 aa  169  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  34.89 
 
 		 426 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  34.71 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  37.14 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  37.14 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  33.73 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  33.97 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  38.89 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  35.78 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  37.66 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  36.84 
 
 		 528 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  37.66 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1990  putative GTP-binding protein  38.24 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.0213321 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  35.25 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  37.19 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  37.66 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  37.66 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  37.34 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  37.66 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  35.95 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  37.66 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  37.66 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  35.64 
 
 		 535 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  35.51 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  37.17 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  37.34 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1588  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.11 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000278278 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  35.42 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  36.75 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  37.34 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  38.38 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  37.66 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  37.34 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  37.34 
 
 		 396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  33.88 
 
 		 426 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  37.34 
 
 		 396 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  34.62 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  34.62 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  34.62 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  34.62 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  34.62 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  34.62 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  35.94 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  34.62 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2277  small GTP-binding protein  34.4 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.92801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2862  GTP-binding proten HflX  36.91 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  32.94 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  34.62 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  39.45 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  38.67 
 
 		 532 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  32.94 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  38.76 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  36.99 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  35.47 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  32.54 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  34.72 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>