47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0707 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 161 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 161 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  44.97 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  31.3 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  44.32 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  34.53 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 181 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  34.82 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  41.11 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 183 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2878  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 235 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.71 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 85 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 208 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 180 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 180 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  39.62 
 
 		 465 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3353  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 403 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 251 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 208 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 187 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 187 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 187 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>