35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0706 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  320  8e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  37.33 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.92 
 
 		 652 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.54 
 
 		 649 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  34.75 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.86 
 
 		 649 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.47 
 
 		 649 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  34.46 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  31.79 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  34 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.27 
 
 		 649 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  35.54 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1534  PUA domain-containing protein  33.82 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.305531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  33.09 
 
 		 606 aa  61.2  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  32.45 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  31.93 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  30.56 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  32.89 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  31.72 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  33.76 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  34.53 
 
 		 546 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  36.36 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  28.97 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  32.43 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  28.33 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  30 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  31.5 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  27.89 
 
 		 546 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  26.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  35.14 
 
 		 566 aa  44.7  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  29.46 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  28.68 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  28.68 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  29.9 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  30.94 
 
 		 626 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>