More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0693 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  60.67 
 
 
539 aa  642    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  63.79 
 
 
554 aa  677    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  64.03 
 
 
557 aa  698    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  68.18 
 
 
550 aa  693    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  68.11 
 
 
549 aa  699    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  67.42 
 
 
548 aa  709    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  61.71 
 
 
551 aa  637    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  61.05 
 
 
553 aa  668    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  60.22 
 
 
543 aa  636    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  62.5 
 
 
545 aa  637    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  100 
 
 
553 aa  1098    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  68.18 
 
 
554 aa  695    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  58.08 
 
 
559 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  59.66 
 
 
552 aa  600  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  59.24 
 
 
551 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  57.79 
 
 
551 aa  595  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  55.86 
 
 
558 aa  593  1e-168  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  56.83 
 
 
562 aa  590  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  55.7 
 
 
542 aa  588  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  55.34 
 
 
555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  55.07 
 
 
570 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  58.67 
 
 
552 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  59.28 
 
 
558 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  58.75 
 
 
554 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  58.46 
 
 
560 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  52.55 
 
 
540 aa  571  1e-161  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  56.71 
 
 
553 aa  568  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  53.85 
 
 
543 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  58.85 
 
 
553 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  54.63 
 
 
542 aa  561  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  54.63 
 
 
545 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  56.57 
 
 
547 aa  556  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  54.13 
 
 
543 aa  557  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  54.63 
 
 
542 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  53.33 
 
 
560 aa  552  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  54.25 
 
 
543 aa  550  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  51.05 
 
 
559 aa  538  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  52.58 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  54.03 
 
 
541 aa  535  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  49.81 
 
 
563 aa  519  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  49.43 
 
 
557 aa  521  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.25 
 
 
529 aa  499  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  47.37 
 
 
554 aa  492  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.23 
 
 
530 aa  489  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  52.27 
 
 
500 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  49.71 
 
 
552 aa  486  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.34 
 
 
536 aa  481  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  49.71 
 
 
558 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.03 
 
 
532 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.88 
 
 
527 aa  476  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  48.22 
 
 
561 aa  474  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  48.47 
 
 
548 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  45.12 
 
 
547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.72 
 
 
555 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.27 
 
 
537 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  44.57 
 
 
535 aa  425  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.49 
 
 
519 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.27 
 
 
528 aa  417  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  44.38 
 
 
528 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.27 
 
 
525 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  40.72 
 
 
538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.86 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.15 
 
 
546 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  42.3 
 
 
541 aa  396  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  39.96 
 
 
570 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  39.28 
 
 
527 aa  389  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  39.34 
 
 
567 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  42.4 
 
 
536 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  39.6 
 
 
559 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  41.17 
 
 
550 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  40.61 
 
 
542 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  40.84 
 
 
548 aa  365  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  41.04 
 
 
535 aa  369  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  39.03 
 
 
551 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  41.51 
 
 
548 aa  365  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  38.9 
 
 
558 aa  365  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  39.2 
 
 
553 aa  363  4e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  38.51 
 
 
553 aa  362  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  38.51 
 
 
553 aa  362  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  39.13 
 
 
577 aa  362  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  40.43 
 
 
527 aa  360  3e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  38.29 
 
 
542 aa  357  2.9999999999999997e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  37.4 
 
 
568 aa  350  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  40.2 
 
 
533 aa  348  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  39.42 
 
 
529 aa  345  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  38.26 
 
 
536 aa  342  9e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  36.4 
 
 
560 aa  340  5e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  37.34 
 
 
563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.14 
 
 
530 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  35.75 
 
 
531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  35.46 
 
 
523 aa  293  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  36.01 
 
 
552 aa  293  7e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  37.04 
 
 
527 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  34.67 
 
 
558 aa  291  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  35.37 
 
 
539 aa  290  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  33.65 
 
 
546 aa  281  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  35.46 
 
 
526 aa  273  6e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  32.51 
 
 
547 aa  270  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  34.56 
 
 
534 aa  267  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  34.56 
 
 
534 aa  267  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>