29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0691 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  100 
 
 
133 aa  259  6e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  38.71 
 
 
385 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  35.29 
 
 
367 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 
370 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 
367 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  33.86 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
257 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  34.45 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1390  Nucleotide binding protein PINc  30.23 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2242  PilT domain-containing protein  26.4 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.335681  hitchhiker  0.00203626 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1989  PilT domain-containing protein  31.93 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  39.58 
 
 
385 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  29.36 
 
 
366 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  37.36 
 
 
383 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  24.43 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0258  nucleotide binding protein, PINc  26.92 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000462302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  33.65 
 
 
364 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0923  PilT domain-containing protein  30.25 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.223217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  32.97 
 
 
363 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  42.22 
 
 
361 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  35.16 
 
 
388 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  34.78 
 
 
377 aa  40.4  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  28.57 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>