90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0690 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  100 
 
 		 327 aa  653    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  60.98 
 
 		 306 aa  364  1e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  52.87 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  55.89 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  55.56 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  55.89 
 
 		 333 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  62.67 
 
 		 305 aa  339  4e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  54.39 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  50.48 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  52.03 
 
 		 340 aa  292  4e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  51.49 
 
 		 337 aa  292  5e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  50.65 
 
 		 334 aa  291  8e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  49.38 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  50.5 
 
 		 339 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  50.5 
 
 		 339 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  50.5 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  50.5 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  50.5 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  50.5 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  50.17 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  50.17 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  46.06 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  49.06 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  46.2 
 
 		 313 aa  272  7e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  49.69 
 
 		 337 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  46.15 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  48.3 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  50.68 
 
 		 337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  47.44 
 
 		 320 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  47.44 
 
 		 320 aa  259  6e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.64 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  46.6 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.66 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.15 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.32 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.89 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  45.82 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  46.25 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  45.45 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.55 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.56 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  47.22 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  46.13 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  45.7 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  45.7 
 
 		 323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.62 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  45.67 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.82 
 
 		 326 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  45.33 
 
 		 349 aa  235  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  45.08 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  46.59 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.47 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.69 
 
 		 324 aa  231  9e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.16 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  45.83 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  37.02 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  38.36 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  37.87 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.13 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.47 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  32.87 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.63 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  36.33 
 
 		 286 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.33 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.72 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.62 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  35.71 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.95 
 
 		 290 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  30.56 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  29.19 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  28.48 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  28.3 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.87 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  23.34 
 
 		 447 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.77 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  24.29 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  25.25 
 
 		 570 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  24.91 
 
 		 601 aa  86.3  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.87 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.92 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.89 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  22.82 
 
 		 691 aa  69.7  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.8 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  27.84 
 
 		 576 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  27.84 
 
 		 576 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  31.06 
 
 		 713 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  21.69 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50377  predicted protein  33.85 
 
 		 755 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2265  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  57.69 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.902084 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1257  Zinc finger TFIIB-type domain protein  48.28 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>