22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0640 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0640  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  100 
 
 
731 aa  1471    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252493  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0997  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  28.47 
 
 
779 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1689  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  28.57 
 
 
781 aa  178  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.317922  normal  0.350479 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01455  hypothetical protein similar to oligosaccharyl transferase (Eurofung)  27.65 
 
 
741 aa  177  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.531962 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0431  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  29.35 
 
 
781 aa  169  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0438  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  27.11 
 
 
826 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82607  oligosaccharyl transferase subunit  29.04 
 
 
745 aa  163  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.214118  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  26.79 
 
 
712 aa  162  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1781  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  27.78 
 
 
777 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0356227 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01850  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 
815 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2025  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.13 
 
 
764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  24.14 
 
 
743 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55197  oligosaccharyl transferase  23.16 
 
 
911 aa  101  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55198  STT3 subunit-like protein  22.4 
 
 
894 aa  101  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835655  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1805  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  25.41 
 
 
738 aa  98.2  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.43 
 
 
853 aa  60.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.91 
 
 
2073 aa  60.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.71 
 
 
851 aa  54.7  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.94 
 
 
851 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  24.84 
 
 
824 aa  49.3  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  23.68 
 
 
891 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  29.55 
 
 
736 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>