241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0621 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0621  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  639    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  31.5 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0057  putative mRNA 3'-end processing factor  31.51 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  28.88 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  27.16 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0055  putative mRNA 3'-end processing factor  31.03 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0060  putative mRNA 3'-end processing factor  30.72 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0072  putative mRNA 3'-end processing factor  31.03 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.56 
 
 		 1017 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  29.94 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1113  hypothetical protein  28.27 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.704257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  28.65 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  27.48 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 422 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  24.84 
 
 		 383 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  24.85 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  24.62 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  26.26 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  25.53 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  25.18 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  27.6 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4103  beta-lactamase-like  30.04 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  25.5 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 591 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1471  putative mRNA 3-end processing factor  27.21 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  23.79 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  23.97 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  25.33 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  26.43 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5293  putative exonuclease involved in mRNA processing  24.91 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08581  RNA processing exonuclease  24.37 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0814782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  26.46 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  25.93 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  23.08 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  23.29 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1169  conserved hypothetical protein  24.75 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.561924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  27.96 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  27.81 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 428 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  28.57 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  26.9 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1519  hypothetical protein  23.83 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  22.9 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  26.88 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  25.4 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  24.73 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  25.17 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  26.07 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  30.36 
 
 		 793 aa  69.3  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  24.26 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  27.05 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  30.66 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  25.81 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  23.23 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  26.6 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  25.71 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  28.57 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  25 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  25.16 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  26.28 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  23.19 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  23.6 
 
 		 616 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0149  RNA procession exonuclease-like protein  23.76 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0104249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  26.57 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  25.36 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  27.05 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  28.57 
 
 		 884 aa  65.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  25 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 821 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1568  RNA procession exonuclease-like protein  23.49 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4880  Beta-lactamase-like  30.26 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419128  hitchhiker  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  27.03 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2414  hypothetical protein  23.71 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  22.56 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  26.79 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  29.46 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  26.43 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  23.75 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2308  hypothetical protein  30.37 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146289  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  26.73 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  25.98 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  24.82 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  25.62 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  27.8 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  27.8 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  25.55 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0787  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1852  putative mRNA 3-end processing factor  28.49 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.681251  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  30 
 
 		 767 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>