More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0579 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  52.74 
 
 
153 aa  148  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  50.71 
 
 
155 aa  147  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
152 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  38.81 
 
 
156 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.97 
 
 
153 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
186 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  37.76 
 
 
153 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  37.76 
 
 
153 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  37.76 
 
 
153 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.97 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  36.81 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 
149 aa  97.1  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.97 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.97 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.25 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.23 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.66 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.51 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.25 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.97 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  36.23 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.23 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.23 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  36.23 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  40.58 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.52 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.23 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.23 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.23 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.97 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.42 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.97 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 
167 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.73 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.25 
 
 
153 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
156 aa  94  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
193 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
193 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
152 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 
157 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.37 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
179 aa  91.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
157 aa  90.9  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
295 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
143 aa  91.3  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  38.58 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.25 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
153 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
154 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.99 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.99 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  34.93 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  31.3 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.99 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.99 
 
 
153 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>