42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0489 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  52.31 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  52.31 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  49.23 
 
 		 185 aa  131  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  47.69 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  42.31 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  45.74 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  44.44 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  37.21 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  42.52 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  41.73 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  39.53 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  44.44 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  43.41 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  41.94 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  39.53 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  42.97 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  40.6 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  42.98 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  38.93 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  38.58 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  38.58 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  38.58 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  45.6 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  39.53 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  39.47 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  39.53 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.17 
 
 		 183 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  34.11 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  35.11 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  31.78 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  32.26 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  28.95 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  31.53 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  31.36 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  35.62 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  32.2 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  34.85 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  34.25 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  27.97 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>