84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0374 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  29.93 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  29.39 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  28.33 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  28.29 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  28.29 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  28.29 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  28.29 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  28.29 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  28.29 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  29.61 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  29.28 
 
 		 337 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  28.1 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  29.28 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  27.96 
 
 		 339 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.51 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  29.28 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.64 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  31.27 
 
 		 331 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.92 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  30.35 
 
 		 333 aa  89.7  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.67 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  30.07 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  29.7 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.85 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  29.07 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.96 
 
 		 308 aa  85.5  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.48 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.11 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.52 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.85 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  27.63 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  29.18 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  27.92 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  26.19 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.93 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  29.08 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.67 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.25 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.62 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.12 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.54 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.54 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  24.44 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.73 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.73 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  30.2 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.47 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.59 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.62 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.55 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.21 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.16 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.99 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.27 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.09 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.25 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.87 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.37 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.73 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  24.48 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.68 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  25.33 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.19 
 
 		 349 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.67 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  24.16 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.28 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.59 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.61 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.21 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.65 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  21.09 
 
 		 570 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  22.55 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.55 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.08 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  22.74 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  22.49 
 
 		 601 aa  56.6  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.42 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  22.64 
 
 		 447 aa  52.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  22.03 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  20.42 
 
 		 576 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  20.42 
 
 		 576 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  19.03 
 
 		 390 aa  42  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>