More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0325 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 863 aa  726    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 886 aa  696    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 869 aa  714    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 864 aa  712    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 865 aa  736    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 865 aa  726    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 886 aa  703    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 865 aa  692    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 906 aa  697    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 858 aa  681    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 855 aa  717    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 886 aa  703    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 809 aa  1667    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 863 aa  710    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 886 aa  701    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 816 aa  610  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 808 aa  593  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 896 aa  559  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 908 aa  550  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 928 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 905 aa  546  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 892 aa  528  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 865 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 806 aa  506  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 865 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 802 aa  497  1e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 880 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 866 aa  498  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 864 aa  487  1e-136  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 808 aa  487  1e-136  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 882 aa  489  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 881 aa  485  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 799 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 880 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 880 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 867 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 881 aa  479  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 874 aa  477  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 884 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 799 aa  473  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 879 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 891 aa  475  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 799 aa  473  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 799 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 883 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 892 aa  465  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 879 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 881 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 883 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 874 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 881 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 771 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 882 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 881 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 880 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 883 aa  442  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 892 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 880 aa  442  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 885 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 880 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 885 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 881 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 887 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 884 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 886 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 881 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 881 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 880 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 888 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 881 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34 
 
 		 846 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.46 
 
 		 836 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 880 aa  432  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 888 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 881 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 922 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 881 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 881 aa  429  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 881 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 881 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 881 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 881 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 881 aa  428  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 885 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 845 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  32.38 
 
 		 861 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 897 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 883 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 883 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2572  valyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 884 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00293466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 909 aa  417  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 876 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 876 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 876 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 911 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 860 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 855 aa  413  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 904 aa  416  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 906 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 884 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>