More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0320 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 
484 aa  971    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.49 
 
 
474 aa  391  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.56 
 
 
472 aa  374  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.84 
 
 
500 aa  362  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.94 
 
 
473 aa  347  3e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.37 
 
 
475 aa  341  2e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  47.01 
 
 
416 aa  334  2e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  41.77 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.67 
 
 
493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.58 
 
 
484 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.74 
 
 
484 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.74 
 
 
484 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.74 
 
 
484 aa  297  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.32 
 
 
484 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.74 
 
 
484 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 
485 aa  292  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.25 
 
 
484 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.97 
 
 
484 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 
484 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 
484 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.48 
 
 
484 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 
484 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 
484 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  44.23 
 
 
371 aa  287  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.74 
 
 
484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.34 
 
 
482 aa  279  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 
482 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.24 
 
 
483 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.14 
 
 
486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.87 
 
 
484 aa  270  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  36 
 
 
482 aa  269  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.58 
 
 
482 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.65 
 
 
482 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.95 
 
 
484 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.65 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.44 
 
 
482 aa  267  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.63 
 
 
482 aa  267  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.44 
 
 
482 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.44 
 
 
482 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  35.44 
 
 
482 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.44 
 
 
482 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.58 
 
 
482 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.9 
 
 
482 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.17 
 
 
482 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.71 
 
 
483 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.71 
 
 
483 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.1 
 
 
484 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.17 
 
 
482 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.71 
 
 
483 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.17 
 
 
482 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.17 
 
 
482 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.17 
 
 
482 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.9 
 
 
484 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.31 
 
 
484 aa  256  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.7 
 
 
484 aa  256  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.34 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.69 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.6 
 
 
515 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.39 
 
 
484 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.69 
 
 
484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 
484 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 
484 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.82 
 
 
484 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.96 
 
 
483 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.72 
 
 
465 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.96 
 
 
484 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.75 
 
 
482 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  33.97 
 
 
484 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.62 
 
 
515 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.91 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  38.71 
 
 
436 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.8 
 
 
380 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.29 
 
 
496 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  37.66 
 
 
369 aa  226  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.9 
 
 
361 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.3 
 
 
370 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.55 
 
 
391 aa  213  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  34.95 
 
 
404 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.6 
 
 
392 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.46 
 
 
390 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  35.28 
 
 
387 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.51 
 
 
392 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.92 
 
 
410 aa  201  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.74 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.14 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.24 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.54 
 
 
389 aa  196  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  35.56 
 
 
395 aa  196  7e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.84 
 
 
383 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.31 
 
 
383 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.34 
 
 
402 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 
413 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.59 
 
 
401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.04 
 
 
383 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.28 
 
 
396 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  37.77 
 
 
335 aa  188  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.85 
 
 
398 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.57 
 
 
389 aa  187  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.91 
 
 
420 aa  186  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>