49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0293 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  62.32 
 
 		 199 aa  192  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  62.32 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  63.04 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  61.59 
 
 		 199 aa  190  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  64.58 
 
 		 194 aa  189  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  65.67 
 
 		 181 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  64.18 
 
 		 176 aa  176  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  57.45 
 
 		 186 aa  173  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  56.34 
 
 		 187 aa  170  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  52.86 
 
 		 181 aa  140  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  51.45 
 
 		 183 aa  135  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  50 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  51.45 
 
 		 206 aa  135  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  48.55 
 
 		 186 aa  134  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  49.28 
 
 		 186 aa  133  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  53.79 
 
 		 181 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  49.28 
 
 		 186 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  50.76 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  51.8 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  47.86 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  49.28 
 
 		 186 aa  130  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  45 
 
 		 186 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  52.27 
 
 		 181 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  47.83 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  51.52 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  45.71 
 
 		 187 aa  128  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  51.52 
 
 		 181 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  45 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  47.41 
 
 		 226 aa  124  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  49.63 
 
 		 247 aa  122  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  43.65 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  45.39 
 
 		 184 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  43.75 
 
 		 184 aa  120  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  50 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  49.62 
 
 		 284 aa  119  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  43.75 
 
 		 184 aa  118  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  44.88 
 
 		 183 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  43.38 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  41.73 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  47.41 
 
 		 232 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  42.86 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  42.86 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  46.38 
 
 		 185 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  43.17 
 
 		 203 aa  107  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  41.98 
 
 		 291 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  40.31 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  36.5 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  27.27 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>