264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0274 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  100 
 
 
214 aa  434  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  55.67 
 
 
208 aa  249  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  54.41 
 
 
208 aa  248  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  53.81 
 
 
226 aa  246  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  54.23 
 
 
207 aa  245  3e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  53.77 
 
 
206 aa  244  8e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  50 
 
 
225 aa  230  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  52.06 
 
 
215 aa  223  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  53.4 
 
 
206 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  53.4 
 
 
247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  54.36 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  53.54 
 
 
269 aa  218  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  53.03 
 
 
263 aa  218  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  50.96 
 
 
259 aa  214  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  51.52 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  51.28 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  52.31 
 
 
214 aa  211  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  46.6 
 
 
202 aa  204  9e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  49.74 
 
 
205 aa  204  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  49.18 
 
 
207 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  48.94 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  47.92 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  49.2 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  50 
 
 
202 aa  195  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  46.88 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  46.88 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  46.88 
 
 
220 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  46.28 
 
 
220 aa  188  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  52.02 
 
 
293 aa  181  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  45.03 
 
 
220 aa  177  8e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  46.29 
 
 
261 aa  167  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  42.19 
 
 
292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39.43 
 
 
290 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  24.22 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  25.32 
 
 
259 aa  58.2  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  22.77 
 
 
255 aa  58.2  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  24.65 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  24.19 
 
 
274 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  25.21 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  23.08 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  23.21 
 
 
235 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  36.26 
 
 
306 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  25.58 
 
 
291 aa  55.1  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  25.47 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  39.13 
 
 
351 aa  54.3  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
262 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  23.98 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  23.11 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  23.11 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  41.79 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  22.77 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  24.11 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  22.83 
 
 
253 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  21.14 
 
 
324 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  22.83 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  23.08 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  21.88 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  21.49 
 
 
262 aa  52.4  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  23.61 
 
 
262 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  21.49 
 
 
260 aa  52  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  23.22 
 
 
256 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  24.8 
 
 
257 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  23.64 
 
 
255 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  23.02 
 
 
281 aa  52  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  22.69 
 
 
267 aa  51.6  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  22.17 
 
 
244 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  23.45 
 
 
260 aa  52  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  23.66 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  23.39 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  23.74 
 
 
257 aa  51.6  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  23.18 
 
 
314 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  23.18 
 
 
343 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  23.87 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  20.36 
 
 
262 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  23.18 
 
 
255 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  21.72 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl561  30S ribosomal protein S2  27.18 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  22.17 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  40.62 
 
 
256 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  23.42 
 
 
280 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  35.63 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  20.36 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  22.97 
 
 
247 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  20.36 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  36.78 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  37.93 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1146  30S ribosomal protein S2  34.62 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  21.82 
 
 
271 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1591  30S ribosomal protein S2  35.53 
 
 
245 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.403502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4082  30S ribosomal protein S2  35.53 
 
 
245 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.610461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4186  30S ribosomal protein S2  35.53 
 
 
245 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  21.71 
 
 
303 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  39.71 
 
 
264 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  22.92 
 
 
283 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  35.94 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  43.4 
 
 
277 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0051  30S ribosomal protein S2  24.64 
 
 
281 aa  48.9  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0293672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  22.22 
 
 
261 aa  48.5  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38990  30S ribosomal protein S2  38.16 
 
 
246 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1343  30S ribosomal protein S2  36.62 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>