More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0230 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 334 aa  673    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  54.03 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  52.24 
 
 		 342 aa  332  4e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  51.94 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  52.55 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  49.12 
 
 		 347 aa  302  4.0000000000000003e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 340 aa  288  8e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  47.43 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  46.83 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  46.83 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  45.85 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  45.43 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  45.26 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  44.25 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  45.15 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  45.75 
 
 		 337 aa  258  7e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  43.58 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  44.98 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  43.54 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  46.57 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  42.99 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  45.35 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  41.76 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  41.59 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  40.71 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  41.12 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  40.71 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  38.99 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  35.61 
 
 		 392 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  33.04 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  33.89 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.21 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  31.01 
 
 		 389 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  34.06 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  31.43 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  31.5 
 
 		 228 aa  68.9  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  36.57 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  33.86 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  32.61 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  30.71 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  26.09 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  33.85 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  27.14 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  33.58 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  33.58 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  31.16 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  27.27 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  30.94 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  35.82 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  31.91 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  32.12 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  32.61 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  33.58 
 
 		 212 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  32.37 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  31.85 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  30.22 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  26.79 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  30.87 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  28.89 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  30.82 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  33.08 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  30.43 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  27.14 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  31.16 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  32.65 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  31.62 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  32.61 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  26.81 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  32.65 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  28.78 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  33.81 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0477  ribosomal protein L3  26.01 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  30.37 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  32.65 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  24.38 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  31.06 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  30.43 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  30.43 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  30.43 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  26.74 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  29.5 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  33.86 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  30.94 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  29.5 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  33.86 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  29.5 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  30.94 
 
 		 219 aa  57  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>