More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0228 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  100 
 
 
90 aa  178  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  50.59 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  48.24 
 
 
86 aa  90.1  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  57.33 
 
 
81 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  47.67 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  51.16 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  55.56 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  54.88 
 
 
87 aa  87  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.62554e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  45.88 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  45.88 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  45.88 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  51.16 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  54.05 
 
 
81 aa  83.2  1e-15  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  2.49681e-09  unclonable  3.35999e-07 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  56 
 
 
81 aa  83.2  1e-15  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  54.67 
 
 
81 aa  82.4  2e-15  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  46.91 
 
 
82 aa  81.3  4e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  48.15 
 
 
153 aa  80.5  7e-15  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  50.6 
 
 
88 aa  79.3  2e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  46.25 
 
 
84 aa  77.4  7e-14  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  57.53 
 
 
81 aa  76.3  1e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  48.75 
 
 
85 aa  72.8  1e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  43.9 
 
 
84 aa  72  3e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  45 
 
 
84 aa  69.7  1e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  50.62 
 
 
86 aa  69.7  1e-11  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  40.26 
 
 
82 aa  68.6  2e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  44.05 
 
 
87 aa  67.8  5e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  40.26 
 
 
83 aa  67  8e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  42.86 
 
 
82 aa  65.1  3e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  2.99035e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  42.86 
 
 
82 aa  65.5  3e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  3.37619e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  45.45 
 
 
82 aa  64.7  4e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  48.24 
 
 
100 aa  64.7  4e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 
96 aa  63.9  7e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 
82 aa  63.9  7e-10  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  42.35 
 
 
96 aa  63.5  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.4312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 
82 aa  62.4  2e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  55.56 
 
 
104 aa  60.8  5e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  58.49 
 
 
97 aa  60.8  5e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  46.48 
 
 
99 aa  60.1  9e-09  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  51.79 
 
 
95 aa  60.1  1e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.50147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  48.65 
 
 
97 aa  59.7  1e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  45.57 
 
 
98 aa  59.3  2e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 
96 aa  58.5  3e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  58.49 
 
 
97 aa  58.2  3e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  44.05 
 
 
96 aa  58.2  4e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  47.44 
 
 
102 aa  58.2  4e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  52.38 
 
 
98 aa  57.8  5e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  56.6 
 
 
97 aa  57.8  6e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  56.6 
 
 
97 aa  57.8  6e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  58.49 
 
 
97 aa  57.4  7e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  41.67 
 
 
95 aa  57.4  7e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  49.3 
 
 
98 aa  57  9e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  49.3 
 
 
98 aa  57  9e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  51.79 
 
 
110 aa  57  9e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  52.38 
 
 
95 aa  56.2  1e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 
100 aa  56.6  1e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  54.72 
 
 
97 aa  56.2  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  54.72 
 
 
97 aa  56.6  1e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  54.72 
 
 
97 aa  56.6  1e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  35.71 
 
 
100 aa  55.5  2e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  7.19358e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  47.89 
 
 
98 aa  56.2  2e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  56.6 
 
 
94 aa  55.8  2e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 
94 aa  55.1  3e-07  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  46.77 
 
 
98 aa  54.7  4e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  40.91 
 
 
100 aa  54.7  4e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.57762e-07  unclonable  6.93674e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  50.79 
 
 
98 aa  54.3  5e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  39.39 
 
 
99 aa  54.3  5e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  46.77 
 
 
98 aa  53.9  6e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  49.21 
 
 
98 aa  53.9  6e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  41.67 
 
 
95 aa  53.9  7e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  6.05336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  53.7 
 
 
96 aa  53.9  7e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0363  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
98 aa  53.9  8e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674139  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1718  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
98 aa  53.9  8e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  54.72 
 
 
102 aa  53.5  8e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
94 aa  53.5  1e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  43.04 
 
 
97 aa  53.5  1e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.85087e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  49.09 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  41.86 
 
 
96 aa  52.4  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  43.04 
 
 
100 aa  52.4  2e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  50.91 
 
 
100 aa  52.4  2e-06  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  35.48 
 
 
93 aa  52.4  2e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  44 
 
 
101 aa  52.8  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  49.06 
 
 
94 aa  52.4  2e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  36.71 
 
 
100 aa  52.8  2e-06  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  45.61 
 
 
94 aa  52.4  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  43.04 
 
 
100 aa  52.4  2e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.23409e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  49.09 
 
 
100 aa  51.6  3e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  40.79 
 
 
98 aa  52  3e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  38.37 
 
 
96 aa  52  3e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  3.19643e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
94 aa  52  3e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0423  50S ribosomal protein L23P  36.96 
 
 
98 aa  51.6  3e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0123777  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  49.09 
 
 
100 aa  51.6  4e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  38.78 
 
 
98 aa  51.6  4e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  50.94 
 
 
99 aa  51.2  4e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  51.92 
 
 
94 aa  51.6  4e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  51.92 
 
 
117 aa  51.2  4e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  6.31754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
99 aa  51.6  4e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
94 aa  51.6  4e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 
95 aa  51.6  4e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  51.92 
 
 
98 aa  51.2  4e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>