More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0184 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 487 aa  961    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  32.48 
 
 		 671 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.36 
 
 		 688 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  32.71 
 
 		 673 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 		 737 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  32.15 
 
 		 672 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  38.99 
 
 		 748 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  33.95 
 
 		 683 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  33.25 
 
 		 672 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  33.25 
 
 		 672 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  33.25 
 
 		 672 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  33.02 
 
 		 672 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  33.25 
 
 		 672 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.58 
 
 		 661 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  32.62 
 
 		 672 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 		 674 aa  192  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  32.4 
 
 		 669 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  37.36 
 
 		 674 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  34.49 
 
 		 662 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 		 666 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  34.83 
 
 		 665 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  31.21 
 
 		 655 aa  188  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  37.01 
 
 		 637 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  37.46 
 
 		 674 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  36.55 
 
 		 666 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.58 
 
 		 666 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  36.25 
 
 		 662 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  33.41 
 
 		 674 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33 
 
 		 659 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.26 
 
 		 668 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  30.72 
 
 		 655 aa  179  7e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  34.08 
 
 		 723 aa  179  8e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  31.86 
 
 		 650 aa  179  8e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.34 
 
 		 666 aa  179  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  31.83 
 
 		 669 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  32.43 
 
 		 669 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  32.38 
 
 		 679 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  30.34 
 
 		 669 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  33.9 
 
 		 673 aa  176  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33 
 
 		 659 aa  176  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  34.13 
 
 		 577 aa  176  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  30.25 
 
 		 649 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  35.95 
 
 		 654 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 		 654 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  34.24 
 
 		 668 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  34.12 
 
 		 1253 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  29.1 
 
 		 500 aa  173  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  35.36 
 
 		 665 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  30.59 
 
 		 644 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  32.17 
 
 		 644 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  34.4 
 
 		 667 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  31.67 
 
 		 617 aa  172  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.91 
 
 		 669 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.82 
 
 		 661 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  31.49 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.18 
 
 		 660 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  30.17 
 
 		 484 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  33.09 
 
 		 668 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  33.09 
 
 		 668 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  33.72 
 
 		 669 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  30.52 
 
 		 669 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  35.06 
 
 		 663 aa  162  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  32.17 
 
 		 666 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  36.25 
 
 		 654 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  33.13 
 
 		 1265 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  36.86 
 
 		 654 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  30.61 
 
 		 495 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  31.38 
 
 		 643 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.97 
 
 		 495 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  34.53 
 
 		 672 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 		 682 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  30.58 
 
 		 1264 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  30.68 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  32.05 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00960  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  31.3 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0180  hydrogenase 4 subunit D  31.94 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  31.46 
 
 		 487 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  33.52 
 
 		 526 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  33.52 
 
 		 526 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  33.52 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  33.52 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  32.33 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  33.52 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  33.52 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  33.03 
 
 		 1245 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  31.18 
 
 		 646 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  34.14 
 
 		 671 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2187  hydrogenase 4 subunit D  33.16 
 
 		 480 aa  150  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  31.6 
 
 		 672 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  28.95 
 
 		 687 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  31.22 
 
 		 486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1283  hydrogenase 4 subunit D  30.43 
 
 		 479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0280034  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  29.82 
 
 		 480 aa  149  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  34.25 
 
 		 670 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  32.16 
 
 		 553 aa  148  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  36.15 
 
 		 660 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  36.15 
 
 		 660 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.95 
 
 		 646 aa  147  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 		 1265 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>