204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0173 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
109 aa  212  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  46 
 
 
118 aa  93.6  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  47.57 
 
 
137 aa  93.6  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  47.87 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  47.19 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.75 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  40.74 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  44.94 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  42 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  44.94 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  33.98 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  36.61 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  33.03 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  41.11 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  45.95 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  35.48 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  43.68 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  43.68 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  34.09 
 
 
245 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  34.02 
 
 
247 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  35.96 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  40.54 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  45.56 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  40.59 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  41.49 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  36.36 
 
 
233 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  35.23 
 
 
245 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  34.29 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  35.16 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  35.23 
 
 
233 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.36 
 
 
260 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  37.93 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  36.05 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  31.46 
 
 
263 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  34.69 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  40.74 
 
 
272 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  34.09 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  36 
 
 
268 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  35.87 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
268 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 
263 aa  53.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  37.37 
 
 
270 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
263 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
276 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  34.88 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  30.85 
 
 
114 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  37.97 
 
 
263 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  40.98 
 
 
257 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  32.38 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  31.03 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  32.95 
 
 
242 aa  50.8  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
258 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  32.22 
 
 
263 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 
300 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  32.29 
 
 
261 aa  50.1  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1407  transcriptional regulator, ModE family  42.45 
 
 
237 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.32404  normal  0.631353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  37.97 
 
 
263 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  37.08 
 
 
269 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  39.36 
 
 
269 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  40.7 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  29.03 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  43.59 
 
 
270 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  43.59 
 
 
270 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  30.49 
 
 
270 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  38.2 
 
 
290 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  38.36 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  34.83 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  34.83 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  36.36 
 
 
270 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  31.4 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0910  transcriptional regulator  38.27 
 
 
289 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  37.88 
 
 
263 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  39.68 
 
 
118 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  29.52 
 
 
266 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  40.26 
 
 
114 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  37.88 
 
 
263 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  37.78 
 
 
269 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0896  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.21 
 
 
365 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  36.99 
 
 
123 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  30.77 
 
 
366 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
268 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  33.73 
 
 
269 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  39.74 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  31.63 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  36.99 
 
 
123 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0963  molybdate metabolism transcriptional regulator  39.74 
 
 
297 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.549295  hitchhiker  0.00109251 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  30.84 
 
 
366 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.96 
 
 
281 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  39.24 
 
 
359 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0386  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.43 
 
 
362 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>