More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0168 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
481 aa  986    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.3 
 
 
454 aa  412  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.17 
 
 
475 aa  374  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.91 
 
 
458 aa  367  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.09 
 
 
457 aa  355  6.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.16 
 
 
458 aa  354  2e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.83 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.11 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.74 
 
 
477 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.46 
 
 
458 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.24 
 
 
458 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.26 
 
 
458 aa  199  9e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.02 
 
 
458 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.29 
 
 
488 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.98 
 
 
474 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.1 
 
 
529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.64 
 
 
478 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  31.42 
 
 
467 aa  180  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.16 
 
 
464 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.75 
 
 
479 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.87 
 
 
503 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.92 
 
 
463 aa  178  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.65 
 
 
437 aa  177  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.39 
 
 
495 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 
552 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.89 
 
 
503 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.78 
 
 
543 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 
479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 
479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.5 
 
 
478 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 
480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.51 
 
 
547 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.99 
 
 
483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.94 
 
 
504 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  29.77 
 
 
512 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  28.22 
 
 
499 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  33.71 
 
 
477 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  33.71 
 
 
477 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  33.71 
 
 
477 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  33.71 
 
 
477 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  33.71 
 
 
477 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.31 
 
 
528 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  26.52 
 
 
542 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  33.71 
 
 
477 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  33.71 
 
 
477 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  30.05 
 
 
445 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 
480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 
480 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.8 
 
 
504 aa  156  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.49 
 
 
497 aa  156  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 
505 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.25 
 
 
480 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 
478 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.69 
 
 
498 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 
505 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 
505 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 
514 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 
478 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.48 
 
 
483 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.29 
 
 
470 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29 
 
 
454 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.3 
 
 
504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.51 
 
 
476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.81 
 
 
475 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.8 
 
 
546 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.07 
 
 
523 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.02 
 
 
456 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 
450 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 
481 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  28.51 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.72 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  29.9 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  30.18 
 
 
480 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.52 
 
 
505 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  26.97 
 
 
488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.57 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.36 
 
 
517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  29.73 
 
 
477 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.46 
 
 
469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.37 
 
 
544 aa  146  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  35.04 
 
 
478 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.86 
 
 
480 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  29.13 
 
 
477 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.2 
 
 
507 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 
478 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 
484 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.45 
 
 
461 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  27.29 
 
 
458 aa  144  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 
462 aa  144  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.61 
 
 
458 aa  143  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.1 
 
 
478 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  27.1 
 
 
505 aa  143  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.55 
 
 
462 aa  142  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  28.06 
 
 
445 aa  141  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.74 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.21 
 
 
460 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.12 
 
 
464 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.69 
 
 
522 aa  140  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>