More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0130 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1780  isoleucyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
1053 aa  1064    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0700208  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2269  isoleucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
1076 aa  804    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.585384  normal  0.126832 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0719  isoleucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
1034 aa  738    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.280166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
1068 aa  749    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3613  isoleucyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
1058 aa  871    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0784  isoleucyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
1033 aa  735    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
977 aa  645    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0606  isoleucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
1062 aa  857    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.63379  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0887  isoleucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
1050 aa  775    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0185  isoleucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
1058 aa  875    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.232804  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1825  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
1068 aa  749    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0152  isoleucyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
1060 aa  823    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0198182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2428  isoleucyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
1068 aa  648    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
1066 aa  967    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00020204  hitchhiker  0.0000151931 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
1024 aa  640    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1199  isoleucyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
1034 aa  748    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.847726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0403  isoleucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
1059 aa  851    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.171836  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0945  isoleucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
1040 aa  773    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
1049 aa  910    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0130  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1062 aa  2164    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.15677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3832  isoleucyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
1091 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1744  isoleucyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
1070 aa  748    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1429  isoleucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
975 aa  654    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1055  isoleucyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
1089 aa  716    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0633304  normal  0.357924 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0104  isoleucyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
1034 aa  749    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
1066 aa  816    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2663  isoleucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
1100 aa  632  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 
1049 aa  634  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
977 aa  624  1e-177  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
991 aa  620  1e-176  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1977  isoleucyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
1033 aa  618  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3131  isoleucyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
1033 aa  616  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0622946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
977 aa  616  1e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2916  isoleucyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
1059 aa  619  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00208386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2241  isoleucyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
1033 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5846  isoleucyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
1049 aa  613  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856436  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2048  isoleucyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
1077 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2550  isoleucyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
1039 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2201  isoleucyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
1033 aa  612  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000414459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2865  isoleucyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
1039 aa  612  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2014  isoleucyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
1033 aa  612  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.987236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2323  isoleucyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
1033 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00762761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1995  isoleucyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
1033 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
1037 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 
1042 aa  607  9.999999999999999e-173  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2186  isoleucyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
1033 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.330623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2027  isoleucyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
1033 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
1060 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.774761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2181  isoleucyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
1033 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
980 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1029  isoleucyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
1048 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101306  decreased coverage  0.00249031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0907  isoleucyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
1066 aa  598  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236278  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2374  isoleucyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
1046 aa  599  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.59228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2880  isoleucyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
1054 aa  595  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.648909  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1416  isoleucyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
1050 aa  592  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.14603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5739  isoleucyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
1073 aa  588  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155547  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
1066 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0727  isoleucyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
1069 aa  579  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.3975  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2971  isoleucyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
1061 aa  577  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0600156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0322  isoleucyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
1079 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204908  normal  0.140126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5088  isoleucyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
1081 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
1031 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0523  isoleucyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
1083 aa  567  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.750565  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0288  isoleucyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
1036 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0423  isoleucyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 
1089 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.844237  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1887  isoleucyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
1080 aa  562  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0011361  decreased coverage  0.00457118 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
1086 aa  562  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1773  isoleucyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 
1084 aa  557  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0211467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2287  isoleucyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
1085 aa  555  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00241936  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1424  isoleucyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
1069 aa  554  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292782  normal  0.0637422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1101  isoleucyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
1091 aa  554  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288529  normal  0.0200655 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0436  isoleucyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 
1108 aa  556  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.31942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4830  isoleucyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
1075 aa  552  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00601966  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0688  isoleucyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
1048 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.973348  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1709  isoleucyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
1080 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000389774  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0920  isoleucyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
1014 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000204285  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1038  isoleucyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
1014 aa  546  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83229  isoleucyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 
1082 aa  543  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0118016  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_908  isoleucyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
1014 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0001157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3252  isoleucyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
1051 aa  545  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3853  isoleucyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
1056 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00150354  decreased coverage  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 
920 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
919 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2036  isoleucyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
1091 aa  539  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00485775  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5753  isoleucyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
1037 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0704  isoleucyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 
1133 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1360  isoleucyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 
1093 aa  528  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0502657  normal  0.211718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3676  isoleucyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
1110 aa  529  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1596  isoleucyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 
1137 aa  524  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
930 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02490  isoleucyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
1134 aa  524  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55429  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3866  isoleucyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
1059 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.265551  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0420  isoleucyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
1129 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.140403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3487  isoleucyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
1059 aa  522  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
1065 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09270  isoleucyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
929 aa  519  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.157511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3793  isoleucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
1067 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.578218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3100  isoleucyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
1044 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1455  isoleucyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
1072 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79812  normal  0.434557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3160  isoleucyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
1044 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.740282  normal  0.237708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>