264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0114 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 399 aa  794    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  27.53 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  31.29 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  30.64 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.88 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  31.08 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.75 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  30.72 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  31.8 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  34.15 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.64 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.79 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  27.79 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  28.76 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  28.76 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  28.76 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.89 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  26.68 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.78 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.53 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 379 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.92 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  34.44 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.77 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.44 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  34.13 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.44 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  25.48 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.02 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  24.12 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  26.29 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  24.56 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  21.43 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  25.26 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  23.67 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.51 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  24.42 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  32.48 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>