48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0097 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  8e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  46.67 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  44.25 
 
 
137 aa  90.5  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  50.54 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  43.81 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  37.9 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  39.29 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  34.31 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  34.65 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  33.66 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  30.28 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  31.19 
 
 
149 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  36.14 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  30.19 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  34.31 
 
 
179 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  27.93 
 
 
222 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  32.5 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  37.5 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  32.18 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  35.63 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  31.03 
 
 
124 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  29.59 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  32.53 
 
 
273 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  34.15 
 
 
200 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  29.59 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  31.68 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  31.03 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  26.73 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  32.5 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  31 
 
 
444 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  28.57 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  27.88 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  30 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  34.48 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  26.92 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  29.1 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  33.75 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  27.27 
 
 
122 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  26.73 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0824  hypothetical protein  24.62 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  25.71 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  32.97 
 
 
229 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  35.16 
 
 
237 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  32.32 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  31.25 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>