More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0093 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  100 
 
 
520 aa  1045    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  43.98 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  44.27 
 
 
506 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  43.25 
 
 
507 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  42.38 
 
 
504 aa  389  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  42.49 
 
 
512 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  43.95 
 
 
509 aa  385  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  43.28 
 
 
506 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  42.18 
 
 
505 aa  382  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  41.58 
 
 
505 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  41.44 
 
 
516 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  41.78 
 
 
505 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  41.19 
 
 
505 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  40.78 
 
 
508 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  40.57 
 
 
505 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  39.14 
 
 
492 aa  342  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  36.9 
 
 
517 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  39.87 
 
 
514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  40.67 
 
 
526 aa  317  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  40.04 
 
 
509 aa  316  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  39.38 
 
 
513 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  39.35 
 
 
522 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  37.4 
 
 
505 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  40.32 
 
 
485 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  37.32 
 
 
509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  37.42 
 
 
516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  38.85 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  38.58 
 
 
518 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  38.58 
 
 
518 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  39.82 
 
 
530 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  42.36 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  38.16 
 
 
511 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  39.56 
 
 
514 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  40.09 
 
 
507 aa  299  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  39.68 
 
 
495 aa  299  7e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  39.82 
 
 
513 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  41.27 
 
 
519 aa  293  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  36.14 
 
 
504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  36.14 
 
 
504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  40.29 
 
 
512 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  34.43 
 
 
450 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
434 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.04 
 
 
434 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
434 aa  193  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.69 
 
 
434 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.7 
 
 
439 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.8 
 
 
434 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.8 
 
 
434 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.73 
 
 
438 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.86 
 
 
435 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.8 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.8 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.8 
 
 
434 aa  191  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.85 
 
 
434 aa  190  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.8 
 
 
434 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.8 
 
 
434 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 
433 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  30.75 
 
 
434 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.31 
 
 
434 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  32.35 
 
 
438 aa  187  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.31 
 
 
434 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.08 
 
 
433 aa  187  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.09 
 
 
434 aa  186  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.93 
 
 
441 aa  186  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.99 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  30.66 
 
 
444 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.82 
 
 
434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  32.22 
 
 
433 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.39 
 
 
430 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  33.17 
 
 
427 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.12 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.83 
 
 
435 aa  181  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.17 
 
 
432 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.98 
 
 
582 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.16 
 
 
433 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  29.95 
 
 
426 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.61 
 
 
431 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.16 
 
 
433 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.27 
 
 
438 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  31.55 
 
 
432 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.67 
 
 
441 aa  177  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.27 
 
 
431 aa  177  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.93 
 
 
432 aa  176  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  30.14 
 
 
426 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  31.48 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.31 
 
 
437 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  30.48 
 
 
433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  30.67 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 
433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.39 
 
 
424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 
433 aa  174  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 
433 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 
433 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 
433 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 
433 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 
433 aa  174  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  31.25 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.12 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.47 
 
 
437 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>