221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0091 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0091  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases-like  100 
 
 
476 aa  937    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.28891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.54 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  24.12 
 
 
481 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  22.74 
 
 
594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  24.42 
 
 
482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.67 
 
 
482 aa  109  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  23.38 
 
 
520 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  26.11 
 
 
481 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  24.36 
 
 
463 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  25.18 
 
 
479 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  23.94 
 
 
617 aa  99.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  24.89 
 
 
476 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  22.18 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  23.71 
 
 
490 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0773  UbiD family decarboxylase  26.23 
 
 
477 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632709  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0231  UbiD family decarboxylase  25.79 
 
 
448 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  24.94 
 
 
504 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  23.86 
 
 
493 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  22.71 
 
 
525 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0962  UbiD family decarboxylase  23.57 
 
 
585 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00051781  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  24.83 
 
 
507 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0215  UbiD family decarboxylase  25.5 
 
 
448 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1757  UbiD family decarboxylase  24.54 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122512  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  24.55 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  24.66 
 
 
486 aa  84  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  25.11 
 
 
486 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.51 
 
 
525 aa  83.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  20.42 
 
 
502 aa  83.2  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  20.42 
 
 
502 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  22.88 
 
 
639 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  21.31 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1864  UbiD family decarboxylase  22.07 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  23.96 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  22.87 
 
 
488 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.77 
 
 
521 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  22.25 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1697  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  22.92 
 
 
484 aa  77.4  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.373117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  25.81 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  23.32 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  23.44 
 
 
522 aa  76.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  20.54 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0242  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  25.41 
 
 
618 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  20.54 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  21.43 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  22.05 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  22.27 
 
 
488 aa  75.1  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.02 
 
 
506 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  23.27 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  22.59 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  23.27 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  20.19 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  21.95 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  23.27 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  21.65 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  20.97 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  23.04 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  23.27 
 
 
492 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  22.02 
 
 
487 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0168  UbiD family decarboxylase  21.9 
 
 
589 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0201007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0437  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  21.84 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.82 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3063  hypothetical protein  22.88 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.99 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  23.04 
 
 
501 aa  71.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.6 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.82 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  22.82 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  22.82 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.82 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.82 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  22.42 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.37 
 
 
498 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.37 
 
 
506 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  22.15 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.82 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  22.49 
 
 
488 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.44 
 
 
497 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.37 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  23.01 
 
 
482 aa  69.3  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  26.15 
 
 
504 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  26.5 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  22.87 
 
 
498 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  22.65 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  22.05 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  21.3 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  25.43 
 
 
621 aa  67  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  21.3 
 
 
488 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  21.92 
 
 
550 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  24.95 
 
 
606 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  21.21 
 
 
488 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0415  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  22.25 
 
 
487 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  21.21 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  21.52 
 
 
488 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2102  carboxylyase-like protein  23.58 
 
 
514 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0359  hypothetical protein  22.97 
 
 
579 aa  64.3  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  22.71 
 
 
496 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0657  UbiD family decarboxylase  20.3 
 
 
503 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  21.65 
 
 
492 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  21.2 
 
 
443 aa  63.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0701  UbiD family decarboxylase  20.47 
 
 
503 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>