18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0089 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  58.33 
 
 
53 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1591  hypothetical protein  51.02 
 
 
581 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  57.14 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_002936  DET0980  hypothetical protein  58.14 
 
 
57 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0205462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0871  hypothetical protein  55.81 
 
 
57 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1448  hypothetical protein  51.06 
 
 
46 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000871419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1250  hypothetical protein  48.94 
 
 
46 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  54.17 
 
 
49 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14080  hypothetical protein  52.08 
 
 
49 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0897  hypothetical protein  45.83 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.756039 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0733  hypothetical protein  52.27 
 
 
47 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.818237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1628  hypothetical protein  38.64 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0890036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0936  hypothetical protein  40 
 
 
51 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4115  hypothetical protein  42 
 
 
55 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68855  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  43.18 
 
 
52 aa  40.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3734  hypothetical protein  42 
 
 
55 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210558  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  42.22 
 
 
49 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.114976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>