More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0087 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0087  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
374 aa  758    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0158  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
386 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
420 aa  77  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.07 
 
 
1099 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
752 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0197  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  28.89 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0804  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
1118 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.89 
 
 
694 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.99 
 
 
461 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
546 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.88 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.23 
 
 
1101 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  26.84 
 
 
664 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 
1124 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  25.54 
 
 
712 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  20.61 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0708  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
513 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.43114  normal  0.211707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  25.88 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.17 
 
 
656 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0500  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
497 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1754  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
505 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  23.61 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
365 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  21.95 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
428 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  27.67 
 
 
439 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  25.32 
 
 
716 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  25.21 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  22.73 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
450 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.21 
 
 
1115 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 
443 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
537 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  28.12 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 
549 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.28 
 
 
509 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.47 
 
 
700 aa  56.6  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  21.49 
 
 
494 aa  56.6  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  23.71 
 
 
442 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  28.85 
 
 
635 aa  56.2  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  23.28 
 
 
442 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  26.56 
 
 
698 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 
678 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
501 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  24.03 
 
 
425 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  27.31 
 
 
636 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  22.45 
 
 
492 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
604 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0770  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
499 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.131456  normal  0.56836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  21.61 
 
 
501 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
626 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 
1120 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  21.88 
 
 
1231 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  22.78 
 
 
927 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  24.73 
 
 
673 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 
1002 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  21.61 
 
 
501 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.78 
 
 
1115 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.78 
 
 
1119 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
438 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  20.08 
 
 
445 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
615 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  25.64 
 
 
683 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
508 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  22.36 
 
 
872 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.78 
 
 
1115 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 
476 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  22.61 
 
 
785 aa  53.5  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
365 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  22.22 
 
 
397 aa  53.5  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
438 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
471 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
494 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  21.61 
 
 
501 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  22.15 
 
 
412 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  22.15 
 
 
412 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  22.15 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.13 
 
 
630 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  24.79 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  22.15 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
423 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  22.15 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.94 
 
 
1115 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>