146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0086 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0086  sugar-phosphate nucleotidyl transferase  100 
 
 
377 aa  756    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.387197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1356  Nucleotidyl transferase  31.52 
 
 
360 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1777  nucleotidyl transferase  31.75 
 
 
363 aa  162  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13003  normal  0.0200486 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1694  nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
363 aa  162  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00229332  normal  0.012326 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1001  nucleotidyl transferase  34.33 
 
 
363 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1604  nucleotidyl transferase  31.25 
 
 
352 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0798438  normal  0.128956 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0427  nucleotidyl transferase  33.76 
 
 
363 aa  153  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195694  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0529  hexapaptide repeat-containing transferase  27.62 
 
 
350 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  27.15 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  25.2 
 
 
397 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.01 
 
 
393 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.46 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  25.58 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  22.03 
 
 
405 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  24.45 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  25.58 
 
 
393 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.49 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  27.44 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.75 
 
 
400 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  26.94 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  27.39 
 
 
439 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  26.53 
 
 
393 aa  87  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.99 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.43 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  24.68 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  25.25 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  24.76 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  25 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  25.25 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  23.51 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  22.92 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  25.52 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  23.72 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  24.18 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  21.73 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  23.38 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  24.38 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  28.47 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  22.8 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  24.68 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  23.16 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.6 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.36 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  23.64 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.36 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.14 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  23.75 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  22.34 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.2 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  24.01 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  26.42 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  22.86 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  24.5 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2516  Nucleotidyl transferase  31.35 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.24 
 
 
358 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.09 
 
 
359 aa  63.5  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  24.46 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.05 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  23.75 
 
 
374 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.29 
 
 
355 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  22.59 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.78 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.43 
 
 
355 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  23.26 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.17 
 
 
357 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.09 
 
 
356 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.49 
 
 
344 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.73 
 
 
320 aa  53.1  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  20.38 
 
 
361 aa  53.1  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  21.13 
 
 
784 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  21.13 
 
 
784 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0424  putative acyltransferase  31.3 
 
 
146 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3266  putative transferase  31.3 
 
 
146 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482396  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0390  putative acyltransferase  31.3 
 
 
146 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.141633  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  20.83 
 
 
784 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.48 
 
 
357 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  22.92 
 
 
784 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  22.92 
 
 
784 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  22.92 
 
 
784 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.13 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  24.92 
 
 
828 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  20.24 
 
 
784 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2139  hexapaptide repeat-containing transferase  30.46 
 
 
176 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328816  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0384  putative acyltransferase  30.43 
 
 
146 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  29.58 
 
 
212 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  20.24 
 
 
784 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2428  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  40.23 
 
 
473 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.127202  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.28 
 
 
357 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  22.22 
 
 
784 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  25 
 
 
218 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  21.34 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  25.54 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  29.73 
 
 
176 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3284  hexapaptide repeat-containing transferase  29.14 
 
 
176 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.619416  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  23.93 
 
 
818 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  23.61 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  23.44 
 
 
785 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0894  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  41.89 
 
 
468 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  21.53 
 
 
784 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  21.51 
 
 
348 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>