45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0069 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
320 aa  648    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  31.65 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  32.33 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  30.32 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  29.24 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  29.26 
 
 
299 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  32.55 
 
 
309 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 
452 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  27.8 
 
 
299 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  26.86 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  28.57 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  27.1 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 
448 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  25.97 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  27 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  29.73 
 
 
179 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  31.98 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  37.11 
 
 
453 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.64 
 
 
190 aa  63.9  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  28.03 
 
 
528 aa  62.4  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  24.58 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  43.53 
 
 
465 aa  59.3  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  29.95 
 
 
429 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 
461 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
435 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  27.27 
 
 
289 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  30.86 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  30.73 
 
 
182 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
461 aa  53.5  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
445 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  35.14 
 
 
78 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  30.91 
 
 
110 aa  49.3  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  30.3 
 
 
450 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  37.23 
 
 
444 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  25.77 
 
 
444 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  29.63 
 
 
449 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  30.46 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
446 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  34.72 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  38.67 
 
 
108 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  36.62 
 
 
193 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  26.14 
 
 
399 aa  42.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  24.67 
 
 
398 aa  42.7  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>