14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0064 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0064  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  335  1.9999999999999998e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2095  hypothetical protein  31.85 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000837407  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0102  hypothetical protein  33.54 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3154  hypothetical protein  30.86 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000133194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1453  protein of unknown function DUF1393  30.95 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0723727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0066  membrane protein-like protein  30.07 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0126213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0314  membrane protein-like protein  30.61 
 
 
260 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000003744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1668  hypothetical protein  34.75 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1767  protein of unknown function DUF1393  30.57 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1255  protein of unknown function DUF1393  33.33 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000641717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0493  hypothetical protein  29.14 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21280  predicted membrane protein  27.78 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000114527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0916  hypothetical protein  28.05 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1376  hypothetical protein  28.83 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00410827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>