More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0040 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  100 
 
 
340 aa  682    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.55 
 
 
321 aa  375  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  57.19 
 
 
320 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  55.91 
 
 
321 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  54.31 
 
 
321 aa  366  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.31 
 
 
325 aa  330  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  43.05 
 
 
402 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  41.61 
 
 
323 aa  226  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  42.53 
 
 
384 aa  226  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  41.58 
 
 
395 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  41.06 
 
 
391 aa  222  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  40.4 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  41.06 
 
 
320 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  40.79 
 
 
313 aa  210  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  39.27 
 
 
304 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  38.67 
 
 
306 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.86 
 
 
521 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  38.33 
 
 
306 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  37.58 
 
 
383 aa  206  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  38.33 
 
 
306 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  39.07 
 
 
330 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  40.33 
 
 
308 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3011  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.78 
 
 
531 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  40.45 
 
 
323 aa  202  5e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  37.62 
 
 
334 aa  202  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  39.49 
 
 
318 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.2 
 
 
520 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  36.93 
 
 
409 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.19 
 
 
528 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3445  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.19 
 
 
528 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  37.87 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3639  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.87 
 
 
528 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.87 
 
 
528 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.87 
 
 
525 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  41.83 
 
 
530 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000100097  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  38.56 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  41.83 
 
 
530 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001914  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  37.62 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0800  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.87 
 
 
525 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  36.57 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  40.87 
 
 
322 aa  194  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.2 
 
 
560 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  41.06 
 
 
320 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.66 
 
 
525 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3326  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.67 
 
 
525 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  37.17 
 
 
510 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0956  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.33 
 
 
527 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.59 
 
 
523 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.2 
 
 
519 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  38.21 
 
 
346 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.87 
 
 
532 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  42.76 
 
 
601 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  37.17 
 
 
319 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.59 
 
 
533 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  35.86 
 
 
353 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.07 
 
 
533 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.07 
 
 
533 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  35.92 
 
 
529 aa  192  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.71 
 
 
314 aa  192  7e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  41.37 
 
 
535 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  41.37 
 
 
535 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01720  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  40.13 
 
 
521 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.94 
 
 
532 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  35.02 
 
 
316 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2044  alkyl hydroperoxide reductase subunit  41.37 
 
 
622 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.94 
 
 
532 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  40.59 
 
 
312 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0217  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  40.13 
 
 
521 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
322 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  36.36 
 
 
313 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  36.51 
 
 
343 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.53 
 
 
523 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2924  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  40.72 
 
 
520 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  37.34 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0793  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.87 
 
 
521 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.599853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  40 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  39.42 
 
 
322 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  39.42 
 
 
322 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  37.84 
 
 
317 aa  190  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.4 
 
 
532 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  39.42 
 
 
322 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.07 
 
 
523 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  37.67 
 
 
317 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  36.09 
 
 
310 aa  189  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  39.42 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.33 
 
 
509 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  39.42 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  37.42 
 
 
302 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  37.01 
 
 
335 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  37.75 
 
 
308 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  39.8 
 
 
326 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  38.36 
 
 
330 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  36.57 
 
 
332 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.14 
 
 
518 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0640975  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  36.62 
 
 
323 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  38.08 
 
 
317 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  40.75 
 
 
325 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.02 
 
 
523 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  38.44 
 
 
396 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  38.08 
 
 
312 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>