More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4307 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 141 aa  280  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  59.23 
 
 		 133 aa  140  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  60 
 
 		 136 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  53.08 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  54.33 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  49.62 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  50.79 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  51.26 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  56 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  52.24 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  46.91 
 
 		 259 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  47.06 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.76 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  44.59 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 283 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  49.25 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  45.59 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 		 254 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1385  transcriptional regulator of MerR family protein  29.93 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  44.05 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  35.16 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.65 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  46.38 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.26 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40.74 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  46.27 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  46.27 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  46.27 
 
 		 278 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  37.33 
 
 		 347 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 171 aa  67  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 193 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  47.83 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 302 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  31.78 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  42.25 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  31.78 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>