More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4292 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4292  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
364 aa  738    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.713465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  45.6 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  47.5 
 
 
340 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.05 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  41.37 
 
 
340 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2538  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.08 
 
 
352 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.655107 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.47 
 
 
326 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.47 
 
 
326 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  43.56 
 
 
338 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  42.48 
 
 
341 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  38.39 
 
 
325 aa  205  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.38 
 
 
333 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.89 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.57 
 
 
363 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  39.37 
 
 
322 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.07 
 
 
685 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  39.73 
 
 
707 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.99 
 
 
330 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  33.12 
 
 
372 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  36.16 
 
 
333 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  30.72 
 
 
326 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.15 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  33.12 
 
 
318 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  35.69 
 
 
308 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  31.25 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.33 
 
 
371 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.33 
 
 
371 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  33.65 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.13 
 
 
459 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  32.76 
 
 
302 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  36.03 
 
 
305 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.88 
 
 
369 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  33.89 
 
 
304 aa  139  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  32.67 
 
 
304 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.88 
 
 
369 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.88 
 
 
369 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.11 
 
 
368 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  31.51 
 
 
459 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  34.8 
 
 
372 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.08 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.76 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.95 
 
 
326 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.19 
 
 
459 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.33 
 
 
371 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  29.15 
 
 
310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  28.08 
 
 
307 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  31.13 
 
 
312 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.08 
 
 
307 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  30.82 
 
 
309 aa  135  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  28.08 
 
 
307 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  28.08 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  28.08 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  28.08 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.01 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  28.08 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  28.08 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.87 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  29.64 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.22 
 
 
479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  31.46 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  28.02 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  28.08 
 
 
307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  32.13 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.93 
 
 
465 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  33.9 
 
 
299 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  34.32 
 
 
308 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  34.13 
 
 
469 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  34.23 
 
 
297 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4971  Cysteine synthase-like protein  32.52 
 
 
379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  34.39 
 
 
456 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  33.66 
 
 
464 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  31.79 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  27.76 
 
 
307 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  32.08 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  32.91 
 
 
310 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  33.87 
 
 
464 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  29.39 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.01 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  34.53 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  32.03 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  31.27 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  33.87 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  29.64 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  33.87 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  30.56 
 
 
315 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  32.73 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  31.02 
 
 
310 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  31.02 
 
 
310 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  34.46 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  29.13 
 
 
453 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  33.77 
 
 
454 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  31.35 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  33.43 
 
 
464 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  31.72 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  34.78 
 
 
309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  33.76 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  32.57 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  33.55 
 
 
461 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.75 
 
 
307 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>