More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4232 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  100 
 
 		 318 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  72.2 
 
 		 331 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  73.7 
 
 		 330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  73.11 
 
 		 335 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  73.14 
 
 		 333 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  73.14 
 
 		 333 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  73.14 
 
 		 333 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  71.25 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  69.13 
 
 		 330 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  69.06 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  62.94 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  63.38 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  63.16 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  63.93 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  61.66 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  62.17 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  61.44 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  63.93 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  60.47 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  60.77 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  58.82 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  59.34 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  59.48 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  58.22 
 
 		 353 aa  362  6e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  59.28 
 
 		 348 aa  361  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  61.92 
 
 		 325 aa  361  8e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  61.22 
 
 		 327 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  59.8 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  58.84 
 
 		 333 aa  358  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  57.81 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  59.93 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  60.77 
 
 		 317 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  60.45 
 
 		 329 aa  349  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  61.09 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  60.2 
 
 		 348 aa  340  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  55.81 
 
 		 333 aa  338  9e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  57.89 
 
 		 344 aa  335  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  55.48 
 
 		 313 aa  332  3e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  54.17 
 
 		 334 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  55.56 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  58.14 
 
 		 329 aa  325  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  55.34 
 
 		 325 aa  325  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  54.1 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  57.48 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  54.11 
 
 		 317 aa  321  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  53.29 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  53.29 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  51.74 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  52.17 
 
 		 334 aa  320  3e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  53.33 
 
 		 319 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  49.85 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  58.51 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  50.82 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  54.98 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  49.52 
 
 		 311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  51.16 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  49.37 
 
 		 333 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  51.62 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 346 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 311 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  47.4 
 
 		 316 aa  301  9e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  49.35 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  49.35 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  49.35 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  52.63 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  50.46 
 
 		 458 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  49.35 
 
 		 314 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  50.66 
 
 		 321 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  48.73 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  48.29 
 
 		 326 aa  298  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  48.1 
 
 		 333 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  48.05 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  48.05 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  50.66 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  49.51 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  47.5 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  48.84 
 
 		 315 aa  295  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  48.7 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  49.5 
 
 		 304 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  49.34 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  51.16 
 
 		 304 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  47.47 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  48.05 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 321 aa  292  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  49.03 
 
 		 346 aa  291  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  47.67 
 
 		 314 aa  292  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 461 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  50.83 
 
 		 332 aa  291  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 461 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  50.98 
 
 		 331 aa  291  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  48.38 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  48.38 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  48.38 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  47.67 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  48.38 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>