More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4204 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
422 aa  816    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  62.66 
 
 
386 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  56.84 
 
 
428 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  50.37 
 
 
402 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 
407 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  48.26 
 
 
403 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  48.26 
 
 
403 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  47.97 
 
 
403 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  44.95 
 
 
393 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  48.77 
 
 
568 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  50.14 
 
 
565 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  48.84 
 
 
404 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  50.25 
 
 
408 aa  286  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  41.9 
 
 
446 aa  280  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 
412 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  45.55 
 
 
431 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  48.36 
 
 
407 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 
416 aa  255  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  44.69 
 
 
406 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  44.14 
 
 
417 aa  245  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 
440 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 
424 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  36.6 
 
 
387 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  36.69 
 
 
387 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  36.69 
 
 
387 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  37.21 
 
 
387 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  36.69 
 
 
387 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 
385 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  36.69 
 
 
387 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  36.6 
 
 
387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  36.43 
 
 
387 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  36.43 
 
 
387 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  36.84 
 
 
381 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  37.21 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  39.88 
 
 
368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
403 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.29 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.48 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.29 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.16 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.98 
 
 
521 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  26.69 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  26.69 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.2 
 
 
421 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  26.69 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.05 
 
 
545 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 
511 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 
613 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.76 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  32.77 
 
 
476 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  32.03 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 
521 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.21 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.43 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  29.55 
 
 
1065 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.31 
 
 
505 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 
512 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 
515 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  31.82 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  30.05 
 
 
475 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  30.05 
 
 
475 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 
491 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  30.05 
 
 
475 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  30.05 
 
 
475 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 
515 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 
532 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 
534 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
463 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.18 
 
 
485 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 
529 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  32.93 
 
 
469 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 
529 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  30.05 
 
 
475 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  32.18 
 
 
487 aa  63.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2366  multidrug efflux system protein MdtE  26.04 
 
 
470 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.62 
 
 
474 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 
475 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.66 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 
525 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 
501 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  32.34 
 
 
476 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  29.13 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  25.97 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  32.34 
 
 
476 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.61 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 
521 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 
517 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2315  multidrug efflux system protein MdtE  25.52 
 
 
470 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  32.65 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.28 
 
 
541 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2475  multidrug efflux system protein MdtE  25.52 
 
 
470 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.829897  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2259  multidrug efflux system protein MdtE  25.52 
 
 
470 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.716187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>