More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4192 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.57 
 
 		 769 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 950 aa  1897    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 		 806 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 		 806 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  54.21 
 
 		 815 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 		 806 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  54.55 
 
 		 830 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  55.82 
 
 		 821 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.93 
 
 		 814 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.68 
 
 		 725 aa  438  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  38.81 
 
 		 838 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 		 695 aa  373  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  36.92 
 
 		 719 aa  336  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  36.54 
 
 		 836 aa  325  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 975 aa  323  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 1245 aa  318  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 979 aa  317  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 		 747 aa  313  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.97 
 
 		 859 aa  310  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 		 1065 aa  309  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 778 aa  301  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.8 
 
 		 1129 aa  301  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  36.68 
 
 		 764 aa  301  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.1 
 
 		 890 aa  290  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  35.89 
 
 		 1306 aa  290  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 		 764 aa  289  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  33.59 
 
 		 1117 aa  286  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  34.28 
 
 		 724 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 		 761 aa  280  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  36.69 
 
 		 803 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  31.13 
 
 		 727 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  36.03 
 
 		 752 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  33.12 
 
 		 825 aa  266  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  30.83 
 
 		 978 aa  264  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5918  glycosyl transferase family 51  31.44 
 
 		 927 aa  264  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  31.72 
 
 		 822 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  33.03 
 
 		 801 aa  258  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  30.56 
 
 		 784 aa  255  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  33.81 
 
 		 712 aa  254  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  30.97 
 
 		 723 aa  253  8.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  32.68 
 
 		 704 aa  253  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  31.61 
 
 		 808 aa  252  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  32.43 
 
 		 732 aa  251  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33 
 
 		 761 aa  246  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.05 
 
 		 905 aa  246  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  32.33 
 
 		 709 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  32.26 
 
 		 735 aa  245  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 		 867 aa  244  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  31.09 
 
 		 774 aa  244  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  30.65 
 
 		 789 aa  244  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  32.12 
 
 		 722 aa  242  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  33.16 
 
 		 770 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.07 
 
 		 648 aa  242  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  32 
 
 		 683 aa  240  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  30.19 
 
 		 676 aa  240  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.63 
 
 		 730 aa  238  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  32.46 
 
 		 763 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.5 
 
 		 734 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.29 
 
 		 739 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.58 
 
 		 661 aa  235  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.43 
 
 		 727 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  29.99 
 
 		 961 aa  234  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  32.44 
 
 		 720 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  32.68 
 
 		 779 aa  234  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.63 
 
 		 649 aa  233  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 819 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  29.54 
 
 		 683 aa  232  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.96 
 
 		 776 aa  232  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  31.16 
 
 		 765 aa  232  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  31.42 
 
 		 817 aa  231  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 683 aa  231  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 683 aa  231  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.52 
 
 		 643 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.52 
 
 		 643 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  31.02 
 
 		 880 aa  230  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  32.38 
 
 		 833 aa  230  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  31.28 
 
 		 723 aa  229  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  29.65 
 
 		 855 aa  229  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  29.49 
 
 		 683 aa  229  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  29.49 
 
 		 683 aa  229  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  31.11 
 
 		 892 aa  229  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  29.49 
 
 		 683 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  31.28 
 
 		 712 aa  228  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  29.27 
 
 		 683 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  31.05 
 
 		 861 aa  227  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  29.78 
 
 		 683 aa  227  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  29.32 
 
 		 683 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  31.91 
 
 		 711 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 		 710 aa  226  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  30.6 
 
 		 757 aa  225  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  29.49 
 
 		 683 aa  223  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.63 
 
 		 714 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  32.14 
 
 		 880 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  33.21 
 
 		 654 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  31.18 
 
 		 712 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  30.02 
 
 		 750 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.26 
 
 		 732 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  30.62 
 
 		 720 aa  222  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.42 
 
 		 687 aa  220  7.999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.63 
 
 		 727 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>