More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4169 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  84.95 
 
 		 93 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  80.43 
 
 		 96 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  80.43 
 
 		 96 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  80.43 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  80.43 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  80.43 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  81.52 
 
 		 96 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  80.43 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  77.17 
 
 		 96 aa  153  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  76.09 
 
 		 96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  73.91 
 
 		 96 aa  150  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  73.91 
 
 		 96 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  73.91 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  73.91 
 
 		 96 aa  144  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  72.53 
 
 		 102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  73.91 
 
 		 96 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  72.83 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  70.97 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  69.57 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  68.48 
 
 		 95 aa  139  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  69.57 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  72.53 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  66.3 
 
 		 101 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  67.39 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  65.22 
 
 		 101 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  71.43 
 
 		 108 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  66.3 
 
 		 98 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  69.57 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  60.87 
 
 		 96 aa  126  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  63.04 
 
 		 95 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  59.78 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  60.82 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  71.43 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  60.87 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  55.91 
 
 		 96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  51.09 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  45.74 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  46.24 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  39.36 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  40 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  40.22 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 154 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 158 aa  67  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  31.52 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  34.48 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>