More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4122 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 275 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  48.18 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 		 319 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.32 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  46.91 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  46.91 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  46.91 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.25 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  51.1 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  44.78 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  44.9 
 
 		 661 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  44.4 
 
 		 659 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  43.83 
 
 		 668 aa  178  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  53.27 
 
 		 637 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 		 664 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  43.88 
 
 		 671 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 		 665 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  42.73 
 
 		 665 aa  171  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  45.02 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  40.27 
 
 		 650 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  43.04 
 
 		 671 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  44.64 
 
 		 701 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  41.3 
 
 		 642 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 		 653 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 		 330 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 258 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.86 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  35.48 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.48 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.48 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  38.86 
 
 		 544 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 327 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.97 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.43 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4721  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 339 aa  92  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  34.57 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25360  short-chain dehydrogenase/reductase acting with NAD or NADP as acceptor  31.47 
 
 		 327 aa  90.1  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.421024  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 255 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 244 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 266 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  36.87 
 
 		 245 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 244 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 244 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0530041  hitchhiker  0.00231678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.64 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 335 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>