140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4056 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  57.55 
 
 		 678 aa  751    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  100 
 
 		 655 aa  1316    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  40.12 
 
 		 679 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  38.86 
 
 		 686 aa  425  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  30.44 
 
 		 673 aa  223  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  30.58 
 
 		 668 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  30.81 
 
 		 668 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.31 
 
 		 599 aa  131  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  24.74 
 
 		 598 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  26.68 
 
 		 674 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  27.76 
 
 		 677 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  24.7 
 
 		 569 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  27.48 
 
 		 680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  26 
 
 		 714 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  27.08 
 
 		 674 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.25 
 
 		 585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  26.81 
 
 		 678 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  26.92 
 
 		 677 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  24.12 
 
 		 663 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  25 
 
 		 673 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  23.6 
 
 		 670 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  25.14 
 
 		 670 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.6 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.77 
 
 		 595 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  25.3 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  25.42 
 
 		 677 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.66 
 
 		 577 aa  101  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.1 
 
 		 570 aa  101  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.78 
 
 		 588 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  23.81 
 
 		 612 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  30.14 
 
 		 690 aa  100  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  24.69 
 
 		 628 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.04 
 
 		 594 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.86 
 
 		 625 aa  99.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  23.24 
 
 		 679 aa  98.6  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  25.04 
 
 		 667 aa  98.6  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  24.66 
 
 		 668 aa  99  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  24.07 
 
 		 595 aa  97.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  23.99 
 
 		 705 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  24.36 
 
 		 591 aa  93.6  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  25.24 
 
 		 690 aa  91.3  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  24.96 
 
 		 557 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  21.91 
 
 		 793 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  23.54 
 
 		 670 aa  89  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  22.56 
 
 		 644 aa  89  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.35 
 
 		 609 aa  89  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1297  acylase and diesterase protein  25 
 
 		 608 aa  89  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.36424  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  32.16 
 
 		 588 aa  88.2  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.64 
 
 		 561 aa  88.2  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.35 
 
 		 534 aa  87.4  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0281  hypothetical protein  35.95 
 
 		 198 aa  87  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.64 
 
 		 576 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  26.04 
 
 		 665 aa  85.5  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  24.3 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.6 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.6 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  25.71 
 
 		 670 aa  84  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  23.13 
 
 		 677 aa  82.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.35 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.16 
 
 		 605 aa  82.4  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.23 
 
 		 611 aa  81.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  24.96 
 
 		 576 aa  80.5  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.31 
 
 		 647 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.55 
 
 		 625 aa  80.1  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.36 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.09 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  23.62 
 
 		 704 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  23.33 
 
 		 571 aa  78.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.89 
 
 		 545 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  22.99 
 
 		 667 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.17 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  23.26 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00440  putative hydrolase, CocE/NonD family  33.85 
 
 		 637 aa  77  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.403131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  25.29 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  29.9 
 
 		 561 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  23.77 
 
 		 667 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.35 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  30.57 
 
 		 599 aa  73.9  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  30.98 
 
 		 615 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  24.34 
 
 		 667 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  22.2 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11190  putative hydrolase, CocE/NonD family  20.87 
 
 		 581 aa  71.6  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290865  normal  0.803564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  24.87 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  20.74 
 
 		 636 aa  70.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  27.63 
 
 		 499 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  26.83 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.75 
 
 		 580 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  23.74 
 
 		 667 aa  69.7  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  24.64 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.53 
 
 		 604 aa  67.4  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  22.31 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  28.66 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  23.36 
 
 		 763 aa  64.7  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  31.47 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  22.49 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 645 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  22.49 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  23.81 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1938  hydrolase CocE/NonD family protein  23.06 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>