More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4042 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  100 
 
 
285 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  65.38 
 
 
296 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  65.96 
 
 
293 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  63.89 
 
 
297 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  65.61 
 
 
293 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  65.61 
 
 
293 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  62.59 
 
 
309 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  63.23 
 
 
298 aa  341  9e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  64.69 
 
 
310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  64.67 
 
 
319 aa  335  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02060  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
311 aa  330  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  58.11 
 
 
316 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02670  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 
328 aa  265  8.999999999999999e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  48.87 
 
 
323 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  49.84 
 
 
323 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  49.51 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  42.75 
 
 
311 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.29 
 
 
310 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.62 
 
 
311 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  43.58 
 
 
311 aa  205  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  49.15 
 
 
337 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.67 
 
 
310 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
317 aa  201  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.83 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  43.77 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  45.6 
 
 
327 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  44.33 
 
 
314 aa  198  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  49.27 
 
 
303 aa  198  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.05 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.52 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  44.31 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  39.19 
 
 
373 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.63 
 
 
334 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
318 aa  193  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
301 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.78 
 
 
314 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
535 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.9 
 
 
301 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  44.96 
 
 
295 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.08 
 
 
299 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  47.35 
 
 
283 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.85 
 
 
330 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.22 
 
 
298 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  44.9 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3339  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.53 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626145  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
329 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  39.88 
 
 
338 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3469  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.14 
 
 
394 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000116518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
466 aa  182  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1006  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.14 
 
 
384 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000329322  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  43.64 
 
 
302 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  43.87 
 
 
292 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.7 
 
 
295 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.96 
 
 
314 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.8 
 
 
293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  41.43 
 
 
316 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.07 
 
 
294 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.7 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.86 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.28 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000687127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.72 
 
 
294 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
504 aa  179  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.71 
 
 
296 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0834  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.7 
 
 
295 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.85 
 
 
298 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.85 
 
 
298 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
469 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0900  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.28 
 
 
301 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
501 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.85 
 
 
294 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.24 
 
 
310 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.7 
 
 
295 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000657167 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
473 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
479 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.28 
 
 
300 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000548174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
465 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3115  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.86 
 
 
352 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000632224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.06 
 
 
298 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.59 
 
 
311 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1163  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.75 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.06 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.97 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
469 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
494 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3130  glutamate--tRNA ligase  38.44 
 
 
319 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000103356  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
498 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
492 aa  171  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  43.84 
 
 
300 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.96 
 
 
315 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.7 
 
 
296 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
466 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
466 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0779  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  38.38 
 
 
290 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00289158  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.12 
 
 
284 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0873  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  39.71 
 
 
299 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0851  Glutamate--tRNA ligase  40.96 
 
 
313 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.31695  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4049  glutamate--tRNA ligase  42.11 
 
 
312 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963278  normal  0.0953958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
467 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0922  glutamate--tRNA ligase  40 
 
 
300 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1031  Glutamate--tRNA ligase  43.19 
 
 
302 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.011538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>