More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3991 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3991  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
388 aa  781    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  51.54 
 
 
395 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  51.13 
 
 
399 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  52.32 
 
 
393 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  50.38 
 
 
393 aa  345  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22150  hemoglobin-like flavoprotein  50.74 
 
 
433 aa  332  5e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.27 
 
 
398 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0423  flavohemoprotein  44.11 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4884  6,7-dihydropteridine reductase  47.74 
 
 
414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.84 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.83 
 
 
412 aa  309  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  46.73 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.09 
 
 
409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3202  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.69 
 
 
440 aa  305  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  46.55 
 
 
400 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.55 
 
 
400 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.33 
 
 
416 aa  300  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2937  globin  46.19 
 
 
404 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000130596  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.5 
 
 
386 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.58 
 
 
403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  42.97 
 
 
386 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.24 
 
 
395 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  44.2 
 
 
429 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.61 
 
 
406 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  41.55 
 
 
422 aa  262  8e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  39.7 
 
 
403 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.51 
 
 
407 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  37.72 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  39.19 
 
 
394 aa  253  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.44 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.18 
 
 
401 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  36.63 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  40.1 
 
 
402 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.1 
 
 
402 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  39.25 
 
 
402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.6 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  39.35 
 
 
399 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  39.35 
 
 
402 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  39.35 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  39.35 
 
 
402 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  39.1 
 
 
402 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  39.1 
 
 
402 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  39.1 
 
 
402 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  39.1 
 
 
402 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  40.4 
 
 
402 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  39.6 
 
 
402 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  39.6 
 
 
402 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.35 
 
 
402 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  40.85 
 
 
401 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  35.25 
 
 
396 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  35.25 
 
 
396 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  35.5 
 
 
396 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  35.68 
 
 
396 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  36.11 
 
 
397 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  36.11 
 
 
397 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  36.18 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  35.59 
 
 
397 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  35.59 
 
 
397 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  35.68 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  35.35 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  35.59 
 
 
397 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  38.77 
 
 
393 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  37.19 
 
 
411 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  35.26 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  38.37 
 
 
393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.11 
 
 
399 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  38.31 
 
 
395 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.73 
 
 
394 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  39.85 
 
 
393 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  38.23 
 
 
392 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  38.23 
 
 
392 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  38.23 
 
 
392 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  37.53 
 
 
393 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  33.83 
 
 
400 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  36.88 
 
 
411 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  36.59 
 
 
392 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  36.57 
 
 
414 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  35.15 
 
 
504 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  37.62 
 
 
414 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  38.19 
 
 
393 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  36.43 
 
 
393 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  38.04 
 
 
393 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.43 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  33 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  39.26 
 
 
413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  34.59 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  32.58 
 
 
396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  34.84 
 
 
396 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  33.25 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  34.08 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  32.17 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  37.15 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  33.58 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  34.08 
 
 
402 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.79 
 
 
393 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  33.83 
 
 
402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  35.32 
 
 
410 aa  196  7e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  33.83 
 
 
402 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  37.15 
 
 
423 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  36.09 
 
 
393 aa  196  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>