More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3987 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  24.68 
 
 
7214 aa  692    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  26.46 
 
 
3770 aa  863    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.830211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  32.19 
 
 
4991 aa  881    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  26.75 
 
 
4080 aa  717    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  28.68 
 
 
3470 aa  1046    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  29.76 
 
 
2174 aa  762    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.32 
 
 
4317 aa  901    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  29.11 
 
 
3291 aa  1214    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.95 
 
 
5953 aa  1223    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.97 
 
 
6889 aa  1314    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.13 
 
 
2385 aa  1033    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  29.57 
 
 
4336 aa  931    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  31.18 
 
 
2151 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  29.59 
 
 
3168 aa  985    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  32.05 
 
 
5929 aa  1107    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  29.74 
 
 
3962 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.17 
 
 
3432 aa  1264    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.96 
 
 
4531 aa  1125    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.57 
 
 
2385 aa  1010    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  29.79 
 
 
4342 aa  858    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.13 
 
 
2385 aa  988    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.65 
 
 
2385 aa  1013    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  31.9 
 
 
3328 aa  973    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  29.14 
 
 
4186 aa  738    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.76 
 
 
3021 aa  907    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  30.07 
 
 
4336 aa  932    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  31.04 
 
 
2154 aa  826    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  29.56 
 
 
3165 aa  981    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.94 
 
 
5926 aa  1083    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  30.94 
 
 
9498 aa  1173    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  30.2 
 
 
5372 aa  983    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  29.48 
 
 
5469 aa  858    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  30.08 
 
 
13537 aa  1230    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.9 
 
 
6676 aa  1283    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  29.97 
 
 
5596 aa  1147    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.71 
 
 
3629 aa  891    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  28.28 
 
 
2867 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  26.05 
 
 
2791 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  30.16 
 
 
3308 aa  1313    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.13 
 
 
3498 aa  959    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  30.51 
 
 
6176 aa  930    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  25.82 
 
 
2894 aa  967    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.13 
 
 
8646 aa  1026    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  30.42 
 
 
6274 aa  946    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  30.89 
 
 
6081 aa  1134    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  30.87 
 
 
4239 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  31.25 
 
 
6072 aa  1147    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  30.53 
 
 
4572 aa  1032    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  30.34 
 
 
3291 aa  1078    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  30.47 
 
 
6272 aa  945    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.39 
 
 
4502 aa  848    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  30.1 
 
 
2136 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  30.13 
 
 
5422 aa  874    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  30.09 
 
 
4882 aa  1143    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.89 
 
 
3002 aa  945    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.38 
 
 
4332 aa  936    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  26.94 
 
 
3114 aa  872    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  24.83 
 
 
2410 aa  683    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.57 
 
 
2385 aa  1010    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.87 
 
 
4968 aa  1213    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  29.04 
 
 
4383 aa  883    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 
2350 aa  801    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  29.98 
 
 
4317 aa  908    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  38.28 
 
 
4290 aa  1321    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  35.34 
 
 
4489 aa  1342    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  33.4 
 
 
2605 aa  798    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  28.72 
 
 
3102 aa  900    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.15 
 
 
2156 aa  788    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  29.29 
 
 
4468 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  26.48 
 
 
2138 aa  761    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  24.61 
 
 
3137 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30.43 
 
 
6661 aa  1141    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  31.47 
 
 
5230 aa  805    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  35.08 
 
 
6999 aa  961    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  36.43 
 
 
7785 aa  1543    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  27.19 
 
 
6404 aa  1021    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  33.87 
 
 
2125 aa  889    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.07 
 
 
3176 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  29.85 
 
 
5467 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  30.88 
 
 
2187 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  31.98 
 
 
5620 aa  934    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  29.48 
 
 
4342 aa  854    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  29.56 
 
 
5149 aa  733    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  32.42 
 
 
2189 aa  874    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  30.73 
 
 
2448 aa  857    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  34.12 
 
 
3524 aa  1426    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  33.11 
 
 
2201 aa  847    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.19 
 
 
5328 aa  1167    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  29.06 
 
 
2151 aa  713    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  30.62 
 
 
1714 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.11 
 
 
8914 aa  1196    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.67 
 
 
2386 aa  1071    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  31.61 
 
 
2386 aa  997    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  30.32 
 
 
3348 aa  1082    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  29.64 
 
 
6006 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.72 
 
 
2370 aa  921    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  30.94 
 
 
2199 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  31.98 
 
 
3352 aa  977    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  28.98 
 
 
8915 aa  898    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  32.86 
 
 
3331 aa  806    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>