173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3978 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 167 aa  336  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  65.88 
 
 		 173 aa  223  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15640  ferritin-like protein  63.91 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00614251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  43.04 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  41.14 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  42.68 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  40.37 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  39.38 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  37.5 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  37.27 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  40.62 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  38.6 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  37.13 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  36.88 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  38.27 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  38.01 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  37.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  32.93 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  38.75 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  33.53 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  36.88 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  34.64 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  34.64 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  32.93 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  34.64 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  33.14 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  32.93 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  32.93 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  32.93 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  34.64 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  34.64 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  34.64 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  32.72 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  32.93 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  34.64 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  34.64 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  32.93 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  32.93 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  32.93 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  34.64 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  32.93 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  34.39 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  33.95 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  32.5 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  35.62 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  32.1 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  35.22 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  31.95 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  34.38 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  35.06 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  40.51 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  32.68 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  32.68 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  32.68 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  33.75 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  35.53 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  34.13 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  32.68 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  35.03 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  39.26 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  31.65 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  32.68 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  33.54 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  37.01 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  32.89 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  32.1 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  38.27 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  34.97 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  37.82 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  31.87 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  31.79 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  36.25 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  37.3 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  32.91 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  30.46 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  37.42 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  32.91 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  30.82 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  33.75 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  36 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  29.94 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  30.46 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  37.42 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  37.42 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  37.42 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  37.42 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  37.42 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  31.48 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  36.81 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  29.3 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  29.3 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  29.3 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  36.81 
 
 		 168 aa  94  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  36.81 
 
 		 168 aa  94  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  35.06 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  31.01 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  33.11 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  36.81 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>