More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3919 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  100 
 
 		 318 aa  620  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  63.06 
 
 		 323 aa  358  5e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  68.29 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  55.39 
 
 		 341 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  60.56 
 
 		 342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  53.67 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  55.06 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  49.06 
 
 		 321 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  53.63 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  44.6 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  49.38 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  48.2 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  48.89 
 
 		 320 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  42.72 
 
 		 336 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  41.32 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  40.61 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  40.95 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  43.87 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  40.36 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  43.73 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 334 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 		 254 aa  244  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  44.97 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 341 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  38.51 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  35.2 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  36.54 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  45.78 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  54.84 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  38.46 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  37.89 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  39.76 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 		 276 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  38.71 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  46.23 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  38.82 
 
 		 329 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  42.35 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  40.91 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  42.02 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  41.67 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  40.45 
 
 		 331 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  50.49 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  40 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  54.63 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  36.72 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  36.72 
 
 		 329 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  40.8 
 
 		 324 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  37.17 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  42.26 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  45.45 
 
 		 265 aa  210  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  37.05 
 
 		 326 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  37.17 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  41.47 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  36.81 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  42.35 
 
 		 328 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 328 aa  208  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  40.78 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  38.67 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 323 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  43.23 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  32.53 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  33.54 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  32.82 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  32.18 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  32.93 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 338 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  31.41 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  40.38 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  29.71 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  26.25 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  37.35 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  30.94 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  34.2 
 
 		 243 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.16 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.87 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 371 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35.09 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  32.9 
 
 		 243 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0424  ABC transporter related  35.93 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.53 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.18 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.71 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>