95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3898 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  100 
 
 		 279 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  65.82 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  65.82 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  64.86 
 
 		 282 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  28.93 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  28.93 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  28.93 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  27.72 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  26.73 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  26.55 
 
 		 405 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  27.23 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  29.71 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  25.09 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  25.09 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  26.3 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  25.37 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  24.21 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  27.71 
 
 		 427 aa  62  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  27.71 
 
 		 427 aa  62  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  27.71 
 
 		 427 aa  62  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  26.43 
 
 		 624 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  26.43 
 
 		 624 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  28.4 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  25.99 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  23.83 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  29.78 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  26.11 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  25.55 
 
 		 624 aa  59.3  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  28.32 
 
 		 407 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  25.21 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  28.65 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  25.68 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  26.89 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.82 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  28.65 
 
 		 414 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  23.36 
 
 		 403 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  22.57 
 
 		 659 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  28.02 
 
 		 406 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  25 
 
 		 425 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  22.57 
 
 		 659 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  31.86 
 
 		 506 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  24.25 
 
 		 490 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  25.49 
 
 		 441 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  25.2 
 
 		 385 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  27.69 
 
 		 383 aa  50.1  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  23.98 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  23.98 
 
 		 359 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  25.87 
 
 		 420 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  24.58 
 
 		 385 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  21.32 
 
 		 386 aa  49.7  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  26.14 
 
 		 646 aa  49.3  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  22.49 
 
 		 663 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  28.07 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  26.63 
 
 		 408 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  26.11 
 
 		 471 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  24.87 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  27.12 
 
 		 430 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  26.7 
 
 		 649 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  23.41 
 
 		 431 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  22.34 
 
 		 437 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  23.19 
 
 		 392 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  24.17 
 
 		 418 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  24.48 
 
 		 416 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  24.82 
 
 		 431 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  24.73 
 
 		 398 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  26.88 
 
 		 469 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  24.48 
 
 		 417 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  24.44 
 
 		 405 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  26.77 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  24.74 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  23.91 
 
 		 435 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  26.74 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  23.89 
 
 		 401 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  21.92 
 
 		 562 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  24.77 
 
 		 417 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  27.32 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  26.09 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  27.32 
 
 		 421 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  24.88 
 
 		 438 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  22.83 
 
 		 514 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  23.89 
 
 		 401 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  24.57 
 
 		 645 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  24.57 
 
 		 645 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  24.57 
 
 		 645 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  27.84 
 
 		 389 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  21.39 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  25.14 
 
 		 450 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  21.39 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  23.87 
 
 		 417 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  26.43 
 
 		 405 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2593  HK97 family phage major capsid protein  27.01 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  24.11 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  22.78 
 
 		 387 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  22.78 
 
 		 388 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  32.61 
 
 		 357 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0701578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>