More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3873 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
545 aa  1108    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  43.64 
 
 
587 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  43.64 
 
 
587 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.21 
 
 
438 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  43.46 
 
 
587 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  48.99 
 
 
806 aa  264  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  46.95 
 
 
790 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  50.18 
 
 
467 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  49.27 
 
 
430 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  49.27 
 
 
430 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  49.27 
 
 
431 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11764  anchored-membrane serine/threonine-protein kinase pknF  51.49 
 
 
476 aa  257  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  47.8 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3427  protein kinase  48.74 
 
 
450 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  47.41 
 
 
621 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  47.41 
 
 
623 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  47.41 
 
 
623 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  41.81 
 
 
671 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  44.55 
 
 
419 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  48.72 
 
 
459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  44.44 
 
 
557 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0720  Serine/threonine protein kinase-related protein  46.25 
 
 
584 aa  237  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.66 
 
 
477 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  47.55 
 
 
539 aa  227  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3912  Serine/threonine protein kinase-related protein  51.75 
 
 
574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.53 
 
 
511 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  41.04 
 
 
589 aa  210  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  43.63 
 
 
574 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.35 
 
 
1373 aa  206  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.39 
 
 
681 aa  203  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  41.84 
 
 
455 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.88 
 
 
668 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  43.63 
 
 
561 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  40.73 
 
 
349 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 
624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 
624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 
624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  42.96 
 
 
625 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.97 
 
 
896 aa  199  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 
576 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  41.15 
 
 
576 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.08 
 
 
594 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  38.06 
 
 
586 aa  193  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  43.7 
 
 
599 aa  193  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  42.27 
 
 
625 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.5 
 
 
681 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.24 
 
 
1023 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.92 
 
 
645 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  44.07 
 
 
571 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.81 
 
 
601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  40.78 
 
 
626 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  40.93 
 
 
566 aa  191  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  38.68 
 
 
661 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  40.12 
 
 
776 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  39.44 
 
 
668 aa  190  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 
480 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.96 
 
 
648 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  38.46 
 
 
626 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 
632 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.92 
 
 
520 aa  188  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  36.81 
 
 
583 aa  189  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  37.59 
 
 
634 aa  188  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.74 
 
 
642 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.25 
 
 
647 aa  187  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.09 
 
 
693 aa  187  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  35.13 
 
 
691 aa  187  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  35.27 
 
 
614 aa  186  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  39.5 
 
 
597 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 
585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  40 
 
 
1053 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.55 
 
 
676 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  37.59 
 
 
672 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  36.5 
 
 
662 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 
729 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.14 
 
 
822 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  40.64 
 
 
700 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  36.75 
 
 
617 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 
568 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0456  serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 
490 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.959747  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 
557 aa  183  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.03 
 
 
769 aa  183  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
891 aa  183  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 
625 aa  183  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4263  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.59 
 
 
315 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  37.5 
 
 
604 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12928  transmembrane serine/threonine-protein kinase I pknI  39.18 
 
 
585 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00758832  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.4 
 
 
584 aa  182  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.36 
 
 
650 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.76 
 
 
598 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.58 
 
 
715 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
569 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.86 
 
 
517 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  32.48 
 
 
667 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.59 
 
 
664 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5558  protein kinase  41.39 
 
 
518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.759172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
938 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  40.46 
 
 
1108 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37 
 
 
681 aa  180  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>