More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3788 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 295 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  56.93 
 
 		 219 aa  216  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  57.59 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  59.66 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 237 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.71 
 
 		 251 aa  62  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 72 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 400 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 198 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 175 aa  48.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3442  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.747618  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>