209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3767 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  39.08 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  37.79 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  35.77 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  34.87 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  31.7 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  31.82 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  28.94 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.18 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  28.94 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  22.01 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  21.17 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25.76 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  28.88 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.45 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  35.76 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  21.85 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  25.56 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  20.65 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  31.21 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  20.65 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  21.38 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  24.15 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  24.81 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  28.45 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  26.62 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  46.73 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  22.86 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  20.45 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  29.96 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  29.07 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  23.36 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  23.47 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  29.2 
 
 		 166 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  53.23 
 
 		 369 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  49.33 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  42.7 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  29.11 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  34.76 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  29.63 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  23.81 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  41.24 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  31.82 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  47.06 
 
 		 355 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  43.94 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  43.53 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  49.25 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  31.11 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  50.85 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  21.24 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  20.85 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 136 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 136 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  31.34 
 
 		 361 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 136 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  33.72 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.66 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 149 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  45.16 
 
 		 133 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>