More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3757 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  100 
 
 		 367 aa  688    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  60.06 
 
 		 355 aa  328  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.43 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  43.21 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  44.64 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  42.46 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  46.87 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.71 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  44.41 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  43.91 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  44.19 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  44.48 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  43.75 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  46.79 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  42.94 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  45.51 
 
 		 346 aa  202  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  47.81 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  46.77 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  40.82 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  44.69 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  39.1 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  38.99 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  42.94 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  41.48 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  41.83 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  40.76 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  38.66 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  38.72 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  38.72 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  38.72 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  38.72 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  38.66 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  36.56 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  38.05 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  41.16 
 
 		 346 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  38.66 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.66 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.66 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  38.66 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  38.66 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  39.17 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  32.52 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  40.19 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4041  transport system permease protein  38.62 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  32.21 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  45.95 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  37.58 
 
 		 346 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  39.17 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  37.26 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  44.71 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  40.82 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  40.12 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  39.63 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  46.15 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.03 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  42.5 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  38.85 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  39.12 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  39.61 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  37.86 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  39.09 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  36.73 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  39.44 
 
 		 348 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  45.63 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  36.56 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  42.63 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2592  transport system permease protein  41.29 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  44.55 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  37.82 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  42.07 
 
 		 663 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4905  transport system permease protein  46.41 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3527  transport system permease protein  40.68 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 338 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  34.53 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  34.53 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  34.94 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  41.67 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  38.25 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  35.83 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  35.83 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  34.64 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  34.64 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2938  transport system permease protein  44.44 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  39.7 
 
 		 329 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.88 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  40.88 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  39.7 
 
 		 329 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  39.7 
 
 		 329 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  39.7 
 
 		 329 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>