200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3687 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  100 
 
 
289 aa  567  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  64.81 
 
 
288 aa  352  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  65.96 
 
 
290 aa  346  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  65.09 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  55.56 
 
 
278 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  44.36 
 
 
617 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  45.1 
 
 
273 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  40.98 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  40.23 
 
 
281 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  40 
 
 
255 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  43.66 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  39.06 
 
 
255 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  38.4 
 
 
279 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  37.7 
 
 
265 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  40.31 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  40.31 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  40.31 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  40.31 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  40.31 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  40.31 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  40.31 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  41.29 
 
 
281 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  38.37 
 
 
261 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  40.61 
 
 
297 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  37.88 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  38.26 
 
 
623 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  39.23 
 
 
253 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  38.78 
 
 
273 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  42.67 
 
 
253 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.79 
 
 
273 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  37.79 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  37.79 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.67 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.6 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.77 
 
 
283 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.17 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.17 
 
 
271 aa  138  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.4 
 
 
270 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  36.26 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  40.56 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.26 
 
 
273 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  35.38 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  36.36 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  34.6 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  39.13 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  37.3 
 
 
304 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  39.08 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  38.4 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  36.19 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3506  siderophore-interacting protein  36.08 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.960559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4383  siderophore-interacting protein  36.08 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347587  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3535  siderophore-interacting protein  36.08 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0880891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3364  siderophore-interacting protein  36.08 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0792017  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02939  predicted siderophore interacting protein  36.08 
 
 
254 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0631  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.08 
 
 
254 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.231291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02889  hypothetical protein  36.08 
 
 
254 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.08 
 
 
254 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.93 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  37.31 
 
 
277 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.53 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  37.31 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  37.45 
 
 
277 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3251  siderophore-interacting protein  35.74 
 
 
254 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.13 
 
 
250 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  34.66 
 
 
251 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3539  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.21 
 
 
268 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.75 
 
 
283 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.83 
 
 
312 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  33.86 
 
 
250 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  38.25 
 
 
289 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.6 
 
 
299 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.86 
 
 
279 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  33.85 
 
 
252 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.47 
 
 
247 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  31.76 
 
 
246 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  35.89 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  33.47 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  35 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.45 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.21 
 
 
285 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  33.68 
 
 
361 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.21 
 
 
256 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.21 
 
 
285 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.38 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  33.59 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3404  siderophore-interacting protein  32.42 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3570  siderophore-interacting protein  32.03 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3508  siderophore-interacting protein  32.03 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000266465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  33.47 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3400  siderophore-interacting protein  32.03 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.81 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  36.02 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.36 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.42 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.63 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.44 
 
 
270 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  31.15 
 
 
247 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3524  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.32 
 
 
254 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.326071  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.16 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3474  siderophore-interacting protein  31.64 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>